More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15200 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15200  acetolactate synthase catalytic subunit  100 
 
 
586 aa  1190    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19129 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10808  thiamine pyrophosphate enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13620)  42 
 
 
562 aa  382  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4075  acetolactate synthase catalytic subunit  37.2 
 
 
611 aa  324  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2924  acetolactate synthase catalytic subunit  37.23 
 
 
576 aa  307  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.304337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3304  acetolactate synthase catalytic subunit  32.34 
 
 
567 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0947  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  30.94 
 
 
543 aa  226  8e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0432  acetolactate synthase catalytic subunit  31.12 
 
 
538 aa  226  9e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2939  acetolactate synthase catalytic subunit  31.18 
 
 
570 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.653705  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1526  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  29.71 
 
 
652 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.29328 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0820  thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  25.38 
 
 
589 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.155153  unclonable  0.0000131955 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4704  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  24.83 
 
 
568 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2867  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.42 
 
 
542 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1644  putative thiamine pyrophosphate-requiring enzyme  26.68 
 
 
554 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1594  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  27.64 
 
 
499 aa  125  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000232472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  28.93 
 
 
543 aa  120  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  26.93 
 
 
578 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2501  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  25.75 
 
 
658 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1662  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.92 
 
 
564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0092  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  27.3 
 
 
561 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.554485  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1817  thiamine pyrophosphate protein central region  25.46 
 
 
595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0705  benzoylformate decarboxylase  27.74 
 
 
539 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214381  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.74 
 
 
572 aa  114  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6205  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.79 
 
 
603 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207188  normal  0.371773 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  26.01 
 
 
551 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1993  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.89 
 
 
605 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15706  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1191  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.71 
 
 
545 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.492896  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  25.3 
 
 
552 aa  112  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4383  thiamine pyrophosphate protein central region  26.48 
 
 
578 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00140196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.44 
 
 
562 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0303  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.1 
 
 
559 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.296158  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4516  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.29 
 
 
605 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.65 
 
 
562 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6210  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.66 
 
 
610 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 
569 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4783  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  26.53 
 
 
604 aa  107  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.158368  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0325  thiamine pyrophosphate protein central region  26.44 
 
 
576 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.555432  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4410  acetolactate synthase  26.13 
 
 
562 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0170739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0770  acetolactate synthase  27.01 
 
 
562 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  24.56 
 
 
572 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2714  acetolactate synthase, large subunit  23.99 
 
 
555 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1761  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  26.75 
 
 
559 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.15439  hitchhiker  0.00802646 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.6 
 
 
588 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1046  acetolactate synthase  25.95 
 
 
562 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0405645  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  26.19 
 
 
563 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  24.7 
 
 
577 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0771  acetolactate synthase  25.95 
 
 
565 aa  103  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  27.92 
 
 
543 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.64 
 
 
547 aa  103  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00325179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0772  acetolactate synthase  25.95 
 
 
565 aa  103  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  25.35 
 
 
557 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2267  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  25.75 
 
 
549 aa  103  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158148 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0666  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.47 
 
 
552 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  23.89 
 
 
587 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2168  acetolactate synthase, large subunit  25.44 
 
 
562 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1903  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.78 
 
 
563 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0956  acetolactate synthase  25.59 
 
 
565 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0823  acetolactate synthase  25.77 
 
 
562 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198921  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0866  acetolactate synthase  25.77 
 
 
562 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.913065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0958  acetolactate synthase  25.77 
 
 
562 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0140  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  23.65 
 
 
565 aa  101  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.78 
 
 
581 aa  101  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.47 
 
 
581 aa  101  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2048  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  27.19 
 
 
596 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.979203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4369  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  25.77 
 
 
610 aa  101  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0920  acetolactate synthase  25.59 
 
 
562 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.143852  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3076  acetolactate synthase catalytic subunit  27.72 
 
 
555 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932178  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  26.91 
 
 
530 aa  100  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2615  pyruvate oxidase  23.38 
 
 
579 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2562  pyruvate oxidase  23.38 
 
 
579 aa  100  8e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2516  acetolactate synthase, large subunit  23.26 
 
 
542 aa  100  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000744784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.08 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  25.95 
 
 
552 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0346  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0944  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding protein  26.98 
 
 
527 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0093  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.152709  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0645  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0521172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  26.06 
 
 
558 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2480  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.20481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  25.35 
 
 
597 aa  98.6  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  27.26 
 
 
605 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0691  sulfoacetaldehyde acetyltransferase  26.09 
 
 
610 aa  98.6  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000259545  normal  0.156409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27 
 
 
534 aa  98.6  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  24.91 
 
 
550 aa  98.2  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1763  acetolactate synthase, large subunit  23.32 
 
 
547 aa  98.2  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2229  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.54 
 
 
579 aa  98.2  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  25.84 
 
 
558 aa  98.2  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.06 
 
 
555 aa  97.8  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  23.39 
 
 
587 aa  97.8  5e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2037  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.5 
 
 
564 aa  97.4  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182642  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8567  thiamine pyrophosphate protein central region  27.18 
 
 
596 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450993  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2981  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 
556 aa  97.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0018312  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3023  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  23.84 
 
 
561 aa  97.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000478309  normal  0.133355 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1048  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  24.35 
 
 
556 aa  96.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0890  benzoylformate decarboxylase  26.01 
 
 
539 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1543  thiamine pyrophosphate protein central region  26.83 
 
 
548 aa  96.7  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  24.65 
 
 
554 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  27.42 
 
 
556 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0887  benzoylformate decarboxylase  25.83 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.152058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3813  acetolactate synthase catalytic subunit  25.93 
 
 
554 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>