More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_15120  adenine phosphoribosyltransferase  100 
 
 
175 aa  335  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.512789  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1697  Adenine phosphoribosyltransferase  56.44 
 
 
163 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.556662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6107  adenine phosphoribosyltransferase  52.76 
 
 
172 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1431  adenine phosphoribosyltransferase  50.32 
 
 
178 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000408759  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1814  adenine phosphoribosyltransferase  54.27 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.068208  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2059  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
168 aa  154  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.178681  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0732  adenine phosphoribosyltransferase  51.9 
 
 
172 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171863  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1804  adenine phosphoribosyltransferase  51.43 
 
 
188 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.05322  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1422  adenine phosphoribosyltransferase  45.03 
 
 
171 aa  153  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000550543  normal  0.533063 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1432  adenine phosphoribosyltransferase  50.33 
 
 
185 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.068464  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3628  adenine phosphoribosyltransferase  47.53 
 
 
173 aa  151  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000134172  normal  0.616678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2616  adenine phosphoribosyltransferase  44.05 
 
 
171 aa  150  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00797468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3049  Adenine phosphoribosyltransferase  54.04 
 
 
185 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1526  adenine phosphoribosyltransferase  43.86 
 
 
171 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0650778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14000  adenine phosphoribosyltransferase  47.85 
 
 
183 aa  148  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.397052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1944  Adenine phosphoribosyltransferase  53.75 
 
 
186 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00976399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0741  adenine phosphoribosyltransferase  46.01 
 
 
172 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000500572  hitchhiker  0.00412029 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2740  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0788  adenine phosphoribosyltransferase  48.45 
 
 
177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.607381  normal  0.0139712 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2586  adenine phosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682112  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0792  adenine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
174 aa  145  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3620  adenine phosphoribosyltransferase  48.48 
 
 
187 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13991  adenine phosphoribosyltransferase  47.24 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.18608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0332  adenine phosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
172 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2115  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
175 aa  144  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00527883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1084  adenine phosphoribosyltransferase  44.1 
 
 
171 aa  144  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.226168  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2050  adenine phosphoribosyltransferase  47.83 
 
 
180 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1399  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
170 aa  143  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.953702  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3610  adenine phosphoribosyltransferase  46.84 
 
 
170 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029573  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3060  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
187 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3199  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
187 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2888  adenine phosphoribosyltransferase  43.2 
 
 
187 aa  141  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.716655  normal  0.100922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6008  adenine phosphoribosyltransferase  46.88 
 
 
181 aa  141  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.937813  hitchhiker  0.00561119 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1445  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
170 aa  140  7e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.909366  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2091  adenine phosphoribosyltransferase  46.95 
 
 
176 aa  140  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1065  adenine phosphoribosyltransferase  45.06 
 
 
173 aa  140  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2074  adenine phosphoribosyltransferase  45.83 
 
 
179 aa  140  9e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0813  adenine phosphoribosyltransferase  41.38 
 
 
177 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3813  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
179 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0904052  normal  0.50341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2318  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0173481  normal  0.0716407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2279  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2194  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1905  adenine phosphoribosyltransferase  45.4 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.637099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2326  adenine phosphoribosyltransferase  48.8 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.954374  normal  0.271167 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2278  adenine phosphoribosyltransferase  44.12 
 
 
181 aa  140  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1205  adenine phosphoribosyltransferase  42.17 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0169  adenine phosphoribosyltransferase  42.77 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0938  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
170 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12200  adenine phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
170 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000836015  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2454  adenine phosphoribosyltransferase  46.41 
 
 
424 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0252819  hitchhiker  0.000000021435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3172  phosphoribosyltransferase  52.84 
 
 
197 aa  139  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186251  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0657  adenine phosphoribosyltransferase  43.87 
 
 
170 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3212  adenine phosphoribosyltransferase  44.85 
 
 
179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.699753  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2163  adenine phosphoribosyltransferase  41.92 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1190  adenine phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
172 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7279  adenine phosphoribosyltransferase  45 
 
 
181 aa  137  7e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0158728  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4333  adenine phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
172 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4396  adenine phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
172 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.0000849403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2310  adenine phosphoribosyltransferase  43.03 
 
 
179 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0841  adenine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
184 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1342  adenine phosphoribosyltransferase  49.09 
 
 
184 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0382674  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1628  adenine phosphoribosyltransferase  44.38 
 
 
187 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50283  normal  0.279113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2391  adenine phosphoribosyltransferase  44 
 
 
185 aa  136  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.360668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1185  adenine phosphoribosyltransferase  41.62 
 
 
176 aa  136  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1692  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
172 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1725  adenine phosphoribosyltransferase  42.24 
 
 
172 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.075871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4255  adenine phosphoribosyltransferase  44.03 
 
 
170 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2511  adenine phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 
170 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000013789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2814  adenine phosphoribosyltransferase  45.75 
 
 
180 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2775  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.781756  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3039  adenine phosphoribosyltransferase  43.04 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350672  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0497  adenine phosphoribosyltransferase  39.26 
 
 
170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.742896  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2246  adenine phosphoribosyltransferase  44.79 
 
 
175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.111495  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0571  adenine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000300234  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2098  adenine phosphoribosyltransferase  43.11 
 
 
174 aa  135  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.898727  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1018  adenine phosphoribosyltransferase  44.94 
 
 
182 aa  135  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.14395  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2323  adenine phosphoribosyltransferase  40.85 
 
 
172 aa  135  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1339  adenine phosphoribosyltransferase  50.93 
 
 
177 aa  135  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.36012  normal  0.406058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0743  adenine phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 
175 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0465531 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1466  adenine phosphoribosyltransferase  43.83 
 
 
173 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000161835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4492  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4303  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4141  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4638  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4542  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4488  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160658 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0708  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4152  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4527  adenine phosphoribosyltransferase  43.4 
 
 
170 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0559  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
183 aa  134  8e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.100039  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3237  adenine phosphoribosyltransferase  42.41 
 
 
179 aa  134  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97458  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2325  adenine phosphoribosyltransferase  42.42 
 
 
179 aa  134  8e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.915682  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1309  adenine phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
181 aa  134  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.107555  normal  0.0516553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2470  adenine phosphoribosyltransferase  39.63 
 
 
172 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15290  adenine phosphoribosyltransferase  51.25 
 
 
187 aa  133  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.863479  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1998  adenine phosphoribosyltransferase  50 
 
 
183 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0411491 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0607  adenine phosphoribosyltransferase  42.94 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.760951  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4212  adenine phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 
181 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3608  adenine phosphoribosyltransferase  40.37 
 
 
182 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.093345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1509  adenine phosphoribosyltransferase  52.12 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0125965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>