More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4158 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4158  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 355 aa  690    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6990  cobalamin synthesis protein P47K  54.47 
 
 		 360 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.81769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5779  cobalamin synthesis protein, P47K  53.08 
 
 		 344 aa  332  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5224  cobalamin synthesis protein, P47K  53.29 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5312  cobalamin synthesis protein, P47K  53.29 
 
 		 335 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5604  cobalamin synthesis protein, P47K  53.29 
 
 		 335 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0283876  normal  0.566087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  40.82 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1052  cobalamin synthesis protein, P47K  63.75 
 
 		 191 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1028  cobalamin synthesis protein P47K  39.81 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.906843  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  37.89 
 
 		 364 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3924  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0777863  normal  0.0144678 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2976  cobalamin synthesis protein P47K  38.29 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1051  cobalamin synthesis CobW domain-containing protein  38.62 
 
 		 190 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.58 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1834  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 373 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.311808  normal  0.553805 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  28.97 
 
 		 373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 355 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  30.21 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.59 
 
 		 335 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.75 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.22 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  28.66 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  28.71 
 
 		 404 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  29.83 
 
 		 376 aa  109  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  26.38 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.23 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  33.57 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  37.7 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  31.35 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.26 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  31.13 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.92 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.49 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.92 
 
 		 347 aa  106  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.95 
 
 		 350 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  32.14 
 
 		 311 aa  105  9e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  34.95 
 
 		 361 aa  105  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.14 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.76 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  27.88 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  29.75 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  28.62 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.14 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  31.65 
 
 		 369 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  31.84 
 
 		 336 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  34.01 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  30.89 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  30.89 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.84 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.63 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.95 
 
 		 353 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  34.16 
 
 		 310 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0316  cobalamin synthesis protein/P47K  30.37 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  29.84 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  27.42 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  28.48 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  31.84 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  31.84 
 
 		 460 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  28.9 
 
 		 364 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.98 
 
 		 449 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  32.12 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  31.84 
 
 		 460 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  31.18 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  32.34 
 
 		 452 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 		 493 aa  100  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  32.02 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  27.93 
 
 		 323 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  32.46 
 
 		 449 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  32.96 
 
 		 379 aa  99.8  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  32.1 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3014  cobalamin synthesis protein, P47K  35.78 
 
 		 540 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 		 364 aa  99.4  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 		 360 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  35.64 
 
 		 367 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.91 
 
 		 365 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.3 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 422 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  36.92 
 
 		 345 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  30.34 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4084  cobalamin synthesis protein, P47K  28.31 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4282  cobalamin synthesis protein, P47K  28.31 
 
 		 420 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.57 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 		 405 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  27.05 
 
 		 407 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  29.21 
 
 		 417 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>