More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3972 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3972  HAD family hydrolase  100 
 
 		 241 aa  477  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4356  HAD family hydrolase  90.78 
 
 		 233 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.582602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7029  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  56.59 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  50.93 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1853  HAD family hydrolase  56.77 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.147437  normal  0.0157174 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  50.75 
 
 		 204 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  46.57 
 
 		 227 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  45.89 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2048  HAD family hydrolase  37.66 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.539587  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4073  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  43.78 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.358464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  32.42 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.63 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  30.17 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  30.84 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.29 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.2 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000024214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.68 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  29.41 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.26 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.14 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2293  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.76 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000494788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.67 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.6 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  37.02 
 
 		 213 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1593  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.08 
 
 		 202 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  36.17 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.88 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0243  HAD family hydrolase  37.86 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.05 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.67 
 
 		 217 aa  106  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1197  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  0.148864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13910  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.65 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.491881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.61 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3906  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.61 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000443869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  38.59 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.11 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2632  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  32.86 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0453  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.1 
 
 		 219 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0045  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  32.89 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  0.617373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  31.72 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.73 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1436  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.905236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1451  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.913842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0029739  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2022  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  29.35 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1175  HAD family hydrolase  38.42 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.98 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01696  predicted hydrolase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1915  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.752357  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2445  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3849  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.12 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184484  hitchhiker  0.000000000456944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1464  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1947  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.504113  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1419  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.93 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.744627  hitchhiker  0.00259415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.305682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0589  HAD family hydrolase  38.74 
 
 		 217 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1905  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.798501  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.77 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1972  2-deoxyglucose-6-phosphatase  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.16 
 
 		 456 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01684  hypothetical protein  34.38 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1717  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.59 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0181  HAD superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  31.02 
 
 		 456 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.58 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4047  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.47 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000965281  normal  0.234971 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.67 
 
 		 235 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.74 
 
 		 396 aa  99.4  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  31.48 
 
 		 456 aa  99.4  5e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  36.65 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  37.5 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0467  HAD family hydrolase  38.02 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3783  HAD family hydrolase  36.7 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0711244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0864  thiamine pyrophosphokinase  36.76 
 
 		 454 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000134495  normal  0.492449 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.67 
 
 		 216 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1388  HAD family hydrolase  33.51 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0637  HAD family hydrolase  37.75 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0545  HAD-superfamily hydrolase  34.03 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  31.28 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  35.26 
 
 		 221 aa  96.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  29.95 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0284  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.18 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458991 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0269  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.98 
 
 		 217 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 232 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  37.57 
 
 		 222 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4184  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0260  haloacid dehalogenase, IA family protein  27.98 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0792  beta-phosphoglucomutase  34.41 
 
 		 215 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.15 
 
 		 188 aa  94  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  33.15 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  33.49 
 
 		 217 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  36.53 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  33.15 
 
 		 188 aa  93.2  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>