22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2567 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2567  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  957    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.352448  normal  0.119435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  79.48 
 
 		 497 aa  700    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  34.57 
 
 		 809 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3996  hypothetical protein  32.08 
 
 		 757 aa  91.3  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.770764  hitchhiker  0.00576328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1733  hypothetical protein  28.11 
 
 		 817 aa  88.2  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  29.28 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0915  hypothetical protein  30.12 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.698111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  33.64 
 
 		 684 aa  60.1  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  32.1 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3613  hypothetical protein  31.18 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.61062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  28.51 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  31.88 
 
 		 619 aa  57  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0355  putative cellulose-binding protein  28.62 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3995  hypothetical protein  30.71 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.861212  hitchhiker  0.00113148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10270  hypothetical protein  27.85 
 
 		 680 aa  51.2  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.791904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1610  hypothetical protein  28.21 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0743787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  29.32 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  27.3 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2425  hypothetical protein  29.63 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  32.23 
 
 		 753 aa  45.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9130  hypothetical protein  24.62 
 
 		 385 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  29.05 
 
 		 1197 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>