41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1148 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1148  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 325 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1038  saccharopine dehydrogenase  88.54 
 
 		 325 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.264702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1168  hypothetical protein  95 
 
 		 202 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1973  Saccharopine dehydrogenase  52.38 
 
 		 304 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000865351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14900  saccharopine dehydrogenase-like oxidoreductase  36.19 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00802223  normal  0.0704992 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  30.6 
 
 		 367 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  25.42 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4394  saccharopine dehydrogenase  25.56 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5058  saccharopine dehydrogenase  25.45 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  24.57 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34724  predicted protein  31.08 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3964  Saccharopine dehydrogenase  30.34 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0685  saccharopine dehydrogenase  38.41 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0753  saccharopine dehydrogenase  38.41 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2993  saccharopine dehydrogenase  23.57 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54890  hypothetical protein  25.94 
 
 		 634 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000285931  unclonable  1.9973799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  26.09 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0190  Saccharopine dehydrogenase and related protein- like protein  27.83 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2611  Saccharopine dehydrogenase  31.25 
 
 		 413 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2343  saccharopine dehydrogenase  22.87 
 
 		 376 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03325  saccharopine dehydrogenase  36.54 
 
 		 457 aa  50.4  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1138  putative transmembrane protein  26.07 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.972053 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3620  saccharopine dehydrogenase  30.05 
 
 		 527 aa  49.7  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00695172 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  26.57 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54900  hypothetical protein  31.82 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000637066  unclonable  7.39539e-22 
 
 
-
 
NC_002936  DET0007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.870936  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2081  saccharopine dehydrogenase  31.28 
 
 		 371 aa  46.2  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.484567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0007  saccharopine dehydrogenase  28.99 
 
 		 387 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2697  hypothetical protein  38.03 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.208385  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1379  hypothetical protein  22.84 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1424  potassium efflux system protein  23.78 
 
 		 371 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00494367  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  23.48 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5612  saccharopine dehydrogenase  22.69 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1361  Saccharopine dehydrogenase  35.45 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1482  hypothetical protein  22.55 
 
 		 394 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0269  saccharopine dehydrogenase  26.44 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.901872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_7  hypothetical protein  27.38 
 
 		 387 aa  42.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3474  saccharopine dehydrogenase  32.77 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5185  NADPH:quinone reductase and related Zn-dependent oxidoreductase-like protein  34.51 
 
 		 584 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0220056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 		 366 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.122533  hitchhiker  0.00990126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>