More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0702 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0702  dihydropteroate synthase  100 
 
 
289 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.595416 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0649  dihydropteroate synthase  91.7 
 
 
289 aa  496  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.163366  hitchhiker  0.00244455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1839  dihydropteroate synthase  71.13 
 
 
287 aa  393  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0851002  normal  0.323163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3839  dihydropteroate synthase  72.22 
 
 
270 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0265276 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0295  dihydropteroate synthase  70.18 
 
 
291 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1314  dihydropteroate synthase  65.96 
 
 
286 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0877  dihydropteroate synthase  68.99 
 
 
319 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7946  dihydropteroate synthase  64.81 
 
 
312 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3417  Dihydropteroate synthase  64.47 
 
 
277 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2145  dihydropteroate synthase  65.56 
 
 
293 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00151259  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1234  dihydropteroate synthase  63.03 
 
 
286 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.0437061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2621  dihydropteroate synthase  72.18 
 
 
290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000495389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4156  dihydropteroate synthase  59.3 
 
 
287 aa  332  5e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000130669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11500  Dihydropteroate synthase  65.19 
 
 
288 aa  330  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4509  dihydropteroate synthase  66.55 
 
 
282 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1874  dihydropteroate synthase  63.54 
 
 
294 aa  325  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.214631  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4236  dihydropteroate synthase  63.64 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.469059 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4006  dihydropteroate synthase  63.27 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.21352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4080  dihydropteroate synthase  63.27 
 
 
291 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2186  dihydropteroate synthase  64.46 
 
 
291 aa  310  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176509  normal  0.813106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1164  dihydropteroate synthase  64.21 
 
 
287 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3311  dihydropteroate synthase  63.47 
 
 
293 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0807  dihydropteroate synthase  56.49 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.653444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0777  dihydropteroate synthase  61.89 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25940  Dihydropteroate synthase  56.51 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.133929  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0978  dihydropteroate synthase  61.21 
 
 
323 aa  281  7.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.891632  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1001  dihydropteroate synthase  57.34 
 
 
308 aa  277  2e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11231  dihydropteroate synthase 2 folP2  63.27 
 
 
318 aa  275  5e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.722416  normal  0.162228 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26890  Dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.483029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  38.2 
 
 
400 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 
285 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  39.27 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  38.77 
 
 
277 aa  176  5e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 
277 aa  175  8e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  40.43 
 
 
278 aa  175  9e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.39 
 
 
394 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14860  Dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.847859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  36.59 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 
278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1304  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.376163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  39.52 
 
 
277 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38.6 
 
 
287 aa  172  5.999999999999999e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
277 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  38.83 
 
 
282 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  35.06 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  35.25 
 
 
266 aa  171  9e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 
286 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  36.86 
 
 
258 aa  171  1e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  37.4 
 
 
277 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  43.42 
 
 
284 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  37.4 
 
 
277 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  39.61 
 
 
277 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
277 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
283 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.88 
 
 
311 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  39.03 
 
 
394 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  40 
 
 
282 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.68 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  37.68 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  37.68 
 
 
280 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  34.81 
 
 
270 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  39.52 
 
 
277 aa  166  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  38.04 
 
 
277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  37.32 
 
 
286 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  37.32 
 
 
277 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  36.6 
 
 
269 aa  166  5e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  36.6 
 
 
269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  39.27 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  38.41 
 
 
396 aa  163  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  37.41 
 
 
397 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  39.35 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  38.02 
 
 
274 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
282 aa  161  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
282 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  39.61 
 
 
282 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  41.47 
 
 
283 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
282 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 
282 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
284 aa  160  3e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  37.25 
 
 
282 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  36.86 
 
 
282 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 
294 aa  158  9e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 
276 aa  158  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  34.11 
 
 
397 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  38.72 
 
 
278 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>