92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3197 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3197  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
391 aa  743    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000344959  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0193  sodium/hydrogen exchanger  61.79 
 
 
394 aa  433  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2077  sodium/hydrogen exchanger  50.13 
 
 
394 aa  349  5e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0449654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0270  sodium/hydrogen exchanger  47.83 
 
 
400 aa  315  9e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1529  sodium/hydrogen exchanger  42.97 
 
 
503 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3111  sodium/hydrogen exchanger  46.76 
 
 
390 aa  290  3e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000824463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1535  sodium/hydrogen exchanger  38.87 
 
 
396 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000176128  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2353  hypothetical protein  38.54 
 
 
541 aa  231  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0089  Sodium/hydrogen exchanger  36.65 
 
 
543 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0828946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2186  Na+/H+-exchanging protein  35.59 
 
 
545 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.601594 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40732  CPA1 family transporter: sodium ion/proton  31.3 
 
 
391 aa  136  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00131155 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30420  predicted protein  29.77 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.726911  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  25.55 
 
 
608 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  25.91 
 
 
651 aa  63.2  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  25.27 
 
 
601 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  23.23 
 
 
598 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  24.45 
 
 
601 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  24.16 
 
 
637 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0483  sodium/hydrogen exchanger  26.98 
 
 
419 aa  54.7  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0611  sodium/hydrogen exchanger  26.15 
 
 
531 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00744487  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  28.31 
 
 
375 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  20.1 
 
 
597 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  26.1 
 
 
639 aa  53.1  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  22.89 
 
 
599 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  25.97 
 
 
641 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4559  potassium/proton antiporter  21.24 
 
 
592 aa  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.875877  normal  0.221715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  23.95 
 
 
666 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  24.17 
 
 
670 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  23.82 
 
 
764 aa  50.8  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  24.51 
 
 
398 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  22.35 
 
 
616 aa  50.4  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1862  sodium/hydrogen exchanger  24.8 
 
 
751 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  22.29 
 
 
619 aa  50.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  23.18 
 
 
602 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  28.51 
 
 
389 aa  50.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  22.02 
 
 
596 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  22.16 
 
 
597 aa  49.3  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  20.32 
 
 
597 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4708  sodium/hydrogen exchanger  26.94 
 
 
715 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0768  potassium/proton antiporter  23.51 
 
 
478 aa  48.9  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0154146  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1681  sodium/hydrogen exchanger  28.38 
 
 
732 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  23.82 
 
 
763 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0499  NaH antiporter protein  23.9 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  24.7 
 
 
669 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  23.33 
 
 
637 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  22.31 
 
 
612 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3272  sodium/hydrogen exchanger  20.8 
 
 
406 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  24.74 
 
 
629 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  23.81 
 
 
611 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  23.81 
 
 
611 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  24.4 
 
 
625 aa  47  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  24.18 
 
 
599 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1221  sodium/hydrogen exchanger  29.79 
 
 
565 aa  46.6  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.082268  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  21.22 
 
 
760 aa  46.6  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  20.7 
 
 
598 aa  46.2  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  23.53 
 
 
673 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1258  sodium/hydrogen exchanger  26.14 
 
 
721 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105109  normal  0.138872 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  27.11 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0757  potassium/proton antiporter  26.61 
 
 
481 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00299818  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  23.72 
 
 
670 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3830  sodium/hydrogen exchanger  35.48 
 
 
706 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.417332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1590  potassium/proton antiporter  19.95 
 
 
498 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.609323  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1732  sodium/hydrogen exchanger  25 
 
 
698 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  22.54 
 
 
623 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  22.87 
 
 
602 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  22.13 
 
 
597 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
652 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1652  sodium/hydrogen exchanger  26.3 
 
 
392 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.248613 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  24.68 
 
 
652 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 
567 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.77 
 
 
567 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2757  potassium/proton antiporter  25.52 
 
 
538 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0614  sodium/hydrogen exchanger  30.95 
 
 
609 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0826  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  30.95 
 
 
609 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0500  sodium/hydrogen exchanger family protein  20.85 
 
 
578 aa  43.5  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.76767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  25.17 
 
 
399 aa  43.1  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1109  sodium/hydrogen exchanger  27.39 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1205  Na+/H+ anti-porter  24.26 
 
 
716 aa  43.5  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  29.61 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6580  sodium/hydrogen exchanger  24.91 
 
 
719 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.070036  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0276  sodium/hydrogen exchanger  24.72 
 
 
401 aa  43.1  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1869  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 
689 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4604  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  30.95 
 
 
609 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A26  Kef-type K+ transport systems, membrane component  30.77 
 
 
320 aa  43.1  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0733  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  30.95 
 
 
609 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  24.06 
 
 
416 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0754  sodium/hydrogen exchanger family protein/TrkA domain protein  30.36 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00133818 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0610  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0609  Na+/H+ antiporter  30.36 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0699  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.36 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0665  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.36 
 
 
609 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>