35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1483 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1483  protein of unknown function DUF1275  100 
 
 		 227 aa  434  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1526  bicupin, oxalate decarboxylase family  32.18 
 
 		 658 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0199  hypothetical protein  28.79 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2609  protein of unknown function DUF1275  28.22 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2182  protein of unknown function DUF1275  26.26 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3429  protein of unknown function DUF1275  27.37 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3558  protein of unknown function DUF1275  27.78 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.326326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0339  hypothetical protein  29.55 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3234  hypothetical protein  27.78 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.577361 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03150  hypothetical protein  28.41 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.198774  hitchhiker  0.00000000973841 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3574  hypothetical protein  25.7 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.507075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6302  hypothetical protein  26.34 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0125374 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0070  hypothetical protein  27.49 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4078  protein of unknown function DUF1275  24.44 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.316044 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2528  hypothetical protein  26.55 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.409014  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5631  protein of unknown function DUF1275  23.4 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1834  hypothetical protein  28.65 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1066  hypothetical protein  28.26 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1767  hypothetical protein  28.65 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.208506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1703  hypothetical protein  24.04 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.346955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2338  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0808147  normal  0.598155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2335  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.000447759  normal  0.901794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2614  protein of unknown function DUF1275  24.02 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2290  protein of unknown function DUF1275  25.23 
 
 		 249 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.879142  normal  0.347075 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3694  hypothetical protein  25.81 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4963  hypothetical protein  27.08 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0180  hypothetical protein  21.9 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000389961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2541  hypothetical protein  40.91 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.383476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2915  hypothetical protein  24.6 
 
 		 233 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2776  hypothetical protein  24.19 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0092  hypothetical protein  23.87 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5273  hypothetical protein  46.34 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4051  protein of unknown function DUF1275  23.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2868  hypothetical protein  24.15 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.831742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4372  protein of unknown function DUF1275  23.39 
 
 		 240 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>