38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2018 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2018  proliferating cell nuclear antigen PcnA  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1792  proliferating cell nuclear antigen  53.47 
 
 		 244 aa  271  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0624  proliferating cell nuclear antigen PcnA  29.67 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1377  proliferating cell nuclear antigen PcnA  23.85 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.163855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1755  proliferating cell nuclear antigen PcnA  27.78 
 
 		 248 aa  99  7e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1682  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.21 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.950147  normal  0.718796 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0438  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.79 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1788  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.93 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0525119 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0986  proliferating cell nuclear antigen PcnA  25.83 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1695  monomeric DNA polymerase sliding clamp  27.27 
 
 		 250 aa  89.7  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0960  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.25 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.520524  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0990  monomeric DNA polymerase sliding clamp  25.82 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1013  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26 
 
 		 249 aa  88.2  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0699  proliferating cell nuclear antigen PcnA  26.56 
 
 		 247 aa  85.1  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.695059  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29196  proliferating cell nuclear antigen  22.27 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.566704  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41357  predicted protein  21.96 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0563637  normal  0.130673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1383  proliferating cell nuclear antigen PcnA  24.29 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0929046  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2250  DNA polymerase sliding clamp subunit A  23.36 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.151772 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1995  proliferating cell nuclear antigen  24.29 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2193  DNA polymerase sliding clamp  23.98 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0521  proliferating cell nuclear antigen PcnA  30.26 
 
 		 242 aa  67.4  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2362  proliferating cell nuclear antigen  21.31 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1027  DNA polymerase sliding clamp  23.79 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.209457  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80864  DNA polymerase delta processivity factor (proliferating cell nuclear antigen)  23.35 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0667  proliferating-cell nuclear antigen-like protein  24.7 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.355101  normal  0.237552 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1015  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.81 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.510505 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0042  proliferating cell nuclear antigen  19.67 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.512471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2041  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.74 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0879  DNA polymerase sliding clamp  22.22 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2653  DNA polymerase sliding clamp  25.39 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0162  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.44 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1648  DNA polymerase sliding clamp  22.31 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2131  proliferating cell nuclear antigen  20.65 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0792  DNA polymerase sliding clamp  20.41 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0330065  normal  0.149639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1392  DNA polymerase sliding clamp  20.88 
 
 		 247 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.529509  normal  0.388206 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4211  Proliferating cell nuclear antigen, PCNA  23.75 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.379548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0051  DNA polymerase sliding clamp subunit B  23.58 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.574423  normal  0.466331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1375  proliferating cell nuclear antigen-like protein protein  30.08 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.148042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>