26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1951 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1951  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 370 aa  748    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1758  putative pseudouridylate synthase  43.71 
 
 		 350 aa  294  1e-78  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1517  putative pseudouridylate synthase  29.5 
 
 		 411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1771  putative pseudouridylate synthase  30.73 
 
 		 411 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.524292  hitchhiker  0.0084243 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0992  putative pseudouridylate synthase  31.14 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1724  putative pseudouridylate synthase  27.74 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.86816 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0599  putative pseudouridylate synthase  28.48 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00101881  hitchhiker  0.0000193518 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3230  putative pseudouridylate synthase  26.28 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000174265  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0906  putative pseudouridylate synthase  28.84 
 
 		 428 aa  90.5  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000000000000179406  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0954  hypothetical protein  25.93 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0354  pseudouridylate synthase  27.8 
 
 		 444 aa  83.6  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1567  putative pseudouridylate synthase  27.91 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.659369  normal  0.0108889 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0643  THUMP domain protein  24.52 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0546  putative pseudouridylate synthase  23.55 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0278451  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3025  putative pseudouridylate synthase  24.88 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1937  putative pseudouridylate synthase  22.46 
 
 		 427 aa  72.4  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2703  hypothetical protein  24.69 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.120087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1875  putative pseudouridylate synthase  23.48 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.451717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1962  putative pseudouridylate synthase  22.46 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1624  THUMP domain protein  24.61 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.443715 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0740  pseudouridylate synthase-like protein  25.22 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1093  putative pseudouridylate synthase  23.27 
 
 		 469 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0712326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0986  putative pseudouridylate synthase  25.11 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0853  putative pseudouridylate synthase  26.53 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1582  putative pseudouridylate synthase  24.33 
 
 		 470 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.640324  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1106  putative pseudouridylate synthase  23.68 
 
 		 474 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>