26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2062 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0281  cation diffusion facilitator family transporter  34.68 
 
 		 304 aa  186  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0952355  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1049  putative Co/Zn/Cd cation transporter  31.54 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1884  Co/Zn/Cd cation transporter  28.23 
 
 		 307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0820  Co/Zn/Cd cation transporter  30.28 
 
 		 301 aa  135  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00173784  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2193  cation diffusion facilitator family transporter  28.57 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2946  cation efflux protein  25.93 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0558  cation efflux protein  28.25 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000438262  normal  0.603969 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1685  CDF family cation efflux system protein  44 
 
 		 83 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.890428  normal  0.971407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2169  cation diffusion facilitator family transporter  23.39 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.986609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2041  hypothetical protein  22.75 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5197  cation efflux protein  22.26 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0750922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3086  cation diffusion facilitator family transporter  26.62 
 
 		 308 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0625445  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2043  hypothetical protein  21.96 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2938  cation diffusion facilitator family transporter  24.08 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.197596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2392  cation diffusion facilitator family transporter  22.17 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.546441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2240  cation diffusion facilitator family transporter  29.81 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.178806  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1227  cation efflux protein  24.63 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.873181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1256  cation efflux protein  24.63 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.274158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0350  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0122115 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0128  cation diffusion facilitator family transporter  27.46 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00780296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4191  cation efflux protein  24.25 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37230  cation diffusion facilitator family transporter  25.81 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2256  cation diffusion facilitator family transporter  28.81 
 
 		 332 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00134926  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0048  cation diffusion facilitator family transporter  25.43 
 
 		 294 aa  42.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3985  cation efflux protein  22.9 
 
 		 319 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>