26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0048 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0048  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 294 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0896  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1627  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1432  cation diffusion facilitator family transporter  25.45 
 
 		 293 aa  92.4  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1822  cation diffusion facilitator family transporter  26.07 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.117404  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  24.47 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  23.23 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  22.71 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  27.72 
 
 		 384 aa  55.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  22.64 
 
 		 410 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  21.98 
 
 		 311 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0634  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 451 aa  53.9  0.000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  unclonable  0.00000102364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  22.31 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  22.43 
 
 		 381 aa  52.8  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  22.54 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  23.05 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08791  CDF iron transporter (Eurofung)  20.38 
 
 		 490 aa  50.1  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.221743  normal  0.15756 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07060  iron ion homeostasis-related protein, putative  31.07 
 
 		 501 aa  50.1  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  24.22 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  27.55 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1673  cation diffusion facilitator family transporter  24.4 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.569502 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  24.18 
 
 		 416 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01795  CDF divalent metal cation transporter (Eurofung)  37.36 
 
 		 500 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.394852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2062  hypothetical protein  24.26 
 
 		 305 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314891 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>