47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0896 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0896  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 294 aa  577  1e-164  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1432  cation diffusion facilitator family transporter  79.59 
 
 		 293 aa  464  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1627  cation diffusion facilitator family transporter  72.03 
 
 		 288 aa  425  1e-118  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1822  cation diffusion facilitator family transporter  69.97 
 
 		 296 aa  402  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.117404  normal  0.386135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0048  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  24.13 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.8 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  24.48 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  24.08 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  23.11 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0586  cation efflux family protein  26.57 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0440871  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0576  cation efflux family protein  26.57 
 
 		 393 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  24.44 
 
 		 396 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  21.43 
 
 		 289 aa  52.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1417  cation diffusion facilitator family transporter  21.74 
 
 		 384 aa  52.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  25.27 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4987  cation diffusion facilitator family transporter  26.71 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00631411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.54 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3583  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 		 392 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1011  cation diffusion facilitator family transporter  25.52 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  23.3 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4080  cation diffusion facilitator family transporter  28.43 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  24.91 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  23.38 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  23.93 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  23.78 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0130  cation diffusion facilitator family transporter  23.69 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.120546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  22.71 
 
 		 421 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  23.38 
 
 		 300 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1832  cation efflux family protein  24.51 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  22.94 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  22.94 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  22.94 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3467  cation diffusion facilitator family transporter  23.56 
 
 		 300 aa  42.7  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1199  cation diffusion facilitator family transporter  26.98 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000135405  hitchhiker  0.00000509926 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4394  ferrous iron efflux protein F  24.23 
 
 		 300 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  27.16 
 
 		 416 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>