36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1822 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1822  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
296 aa  586  1e-166  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.117404  normal  0.386135 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1627  cation diffusion facilitator family transporter  71.58 
 
 
288 aa  420  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0896  cation diffusion facilitator family transporter  69.97 
 
 
294 aa  419  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122697  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1432  cation diffusion facilitator family transporter  70.61 
 
 
293 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0048  cation diffusion facilitator family transporter  25.71 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
400 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  28.21 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  25.91 
 
 
428 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  24.66 
 
 
416 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  26.03 
 
 
318 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3764  cation efflux protein  24.18 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  22.38 
 
 
381 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1531  cation diffusion facilitator family transporter  24.1 
 
 
317 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  25.35 
 
 
298 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  24.33 
 
 
301 aa  49.3  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  21.03 
 
 
289 aa  49.3  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  22.87 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  23.94 
 
 
450 aa  47.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  22.86 
 
 
396 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  22.43 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  22.22 
 
 
437 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  25 
 
 
395 aa  46.6  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0577  cation diffusion facilitator family transporter  26.13 
 
 
308 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.215169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  21.05 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  22.7 
 
 
337 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  24.49 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  27.15 
 
 
298 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0754  cation diffusion facilitator family transporter  26.27 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00172245  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3548  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.058207 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  30.37 
 
 
421 aa  43.5  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  22.73 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3458  cation diffusion facilitator family transporter  23.4 
 
 
413 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  24.04 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  20.76 
 
 
304 aa  42.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0737  cation efflux system protein  26.32 
 
 
317 aa  42.4  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.338743  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  22.52 
 
 
297 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>