36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1627 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1627  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1432  cation diffusion facilitator family transporter  75.87 
 
 		 293 aa  432  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0896  cation diffusion facilitator family transporter  72.03 
 
 		 294 aa  425  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1822  cation diffusion facilitator family transporter  71.58 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.117404  normal  0.386135 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0048  cation diffusion facilitator family transporter  24.73 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0839  Co/Zn/Cd cation transporter  27.74 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000456084  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19310  cation diffusion facilitator family transporter  25.09 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000504538 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3647  cation diffusion facilitator family transporter  25.77 
 
 		 395 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1832  cation efflux system protein  23.08 
 
 		 410 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1276  cation diffusion facilitator family transporter  23.55 
 
 		 416 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0044  cation diffusion facilitator family transporter  23.02 
 
 		 381 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1752  cation diffusion facilitator family transporter  26.01 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00011926  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2257  cation diffusion facilitator family transporter  29.41 
 
 		 416 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3406  cation diffusion facilitator family transporter  24.28 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1741  cation diffusion facilitator family transporter  24.83 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00244826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1123  ferrous-iron efflux pump FieF  19.46 
 
 		 289 aa  48.9  0.00009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00791465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0618  cation diffusion facilitator family transporter  22.75 
 
 		 411 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000865863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1961  cation diffusion facilitator family transporter  24.82 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  25.25 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0088  cation diffusion facilitator family transporter  25.69 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1360  cation diffusion facilitator family transporter  22.91 
 
 		 396 aa  48.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0496  cation diffusion facilitator family transporter  23.81 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.920568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1224  cation diffusion facilitator family transporter  25.46 
 
 		 421 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0960  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 		 291 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1496  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1214  cation diffusion facilitator family transporter  24.56 
 
 		 406 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0101557  hitchhiker  0.000000113777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09106  cobalt-zinc-cadmium resistance protein czcD  27.4 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.341807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1002  cation efflux protein  28.03 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000361576 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0167  cation diffusion facilitator family transporter  26.24 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1684  cation diffusion facilitator family transporter  25.32 
 
 		 450 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000631579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2098  cation diffusion facilitator family transporter  25.33 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1668  cation diffusion facilitator family transporter  24.24 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0340924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0245  cation diffusion facilitator family transporter  23.73 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1245  cation diffusion facilitator family transporter  21.83 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0974  cation diffusion facilitator family transporter  23.08 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0941  cation efflux protein  29.33 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.754529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>