69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1718 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1718  O-methyltransferase, putative  100 
 
 		 357 aa  742    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000763077 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2873  O-methyltransferase family protein  81.79 
 
 		 360 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1680  O-methyltransferase, putative  73.95 
 
 		 357 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.275559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2128  O-methyltransferase, putative  71.71 
 
 		 359 aa  542  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2384  O-methyltransferase family protein  69.47 
 
 		 355 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401072 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2905  O-methyltransferase, putative  66.39 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2765  O-methyltransferase family protein  66.11 
 
 		 363 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.974745  hitchhiker  0.00708299 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1566  methyltransferase type 12  66.39 
 
 		 357 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2371  O-methyltransferase family protein  67.79 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1499  methyltransferase type 12  66.39 
 
 		 357 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1560  methyltransferase type 12  65.55 
 
 		 357 aa  517  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2686  O-methyltransferase family protein  65.83 
 
 		 357 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0445752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1698  O-methyltransferase family 2  65.83 
 
 		 357 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000510936 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1505  O-methyltransferase, putative  56.51 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.538539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4566  O-methyltransferase family 2  52.01 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3883  O-methyltransferase family protein  53.49 
 
 		 354 aa  388  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.181684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1862  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4796  O-methyltransferase, family 2  51.01 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2107  putative O-methyltransferase  50.29 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004060  SAM-dependent methyltransferase  49.13 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2121  SAM-dependent methyltransferase  47.06 
 
 		 356 aa  358  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.212274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0717  O-methyltransferase family 2  48.84 
 
 		 365 aa  348  6e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5794  Methyltransferase type 12  48.42 
 
 		 352 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2096  Methyltransferase type 12  44.03 
 
 		 357 aa  325  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3121  O-methyltransferase family protein  25 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2188  hypothetical protein  26.07 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4414  methyltransferase type 12  22.87 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09490  putative phenazine-specific methyltransferase  26.06 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2253  C-20 methyltransferase BchU  32.43 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2106  Methyltransferase type 12  22.34 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1733  O-methyltransferase family protein  25.29 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.561962  normal  0.248691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0115  CrtF-related protein  30.97 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0394  methyltransferase type 12  27.32 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0889  putative phenazine-specific methyltransferase  27.27 
 
 		 334 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2333  O-methyltransferase family protein  20.81 
 
 		 328 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000436315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0771  hypothetical protein  21.76 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2963  O-methyltransferase family 2  24.83 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.193819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2496  C-20 methyltransferase BchU  36.27 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.409107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1725  O-methyltransferase family 2  22.93 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2512  C-20 methyltransferase BchU  32.14 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.669224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2752  C-20 methyltransferase BchU  32.04 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2758  C-20 methyltransferase BchU  23.97 
 
 		 339 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.160488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7639  O-methyltransferase family 2  28.57 
 
 		 359 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2402  methyltransferase type 12  22.39 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2714  O-methyltransferase family protein  30.13 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0330772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  25.84 
 
 		 252 aa  50.4  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2149  O-methyltransferase family 2  25.42 
 
 		 335 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2361  Methyltransferase type 12  22.39 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0597  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, ribosomal protein L3-specific  30.1 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000828022  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1149  O-methyltransferase family 2  21.02 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2103  CrtF-related protein  31.25 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0181  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  24.73 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1917  hypothetical protein  25.89 
 
 		 630 aa  47  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4955  O-methyltransferase family protein  25.23 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2173  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190617 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2230  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.392557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2184  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.14 
 
 		 363 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1211  C-20 methyltransferase BchU  26.67 
 
 		 354 aa  46.2  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.40685  normal  0.147915 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1720  O-methyltransferase family protein  23.77 
 
 		 364 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.365884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2071  O-methyltransferase family 2  22.16 
 
 		 335 aa  46.2  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0926  O-methyltransferase family protein  18.69 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000122427  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6286  O-methyltransferase family 2  23.31 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3993  methyltransferase type 12  23.21 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.207791  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1906  hypothetical protein  24.11 
 
 		 630 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6962  hydroxyneurosporene-O-methyltransferase  26.17 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.797096  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1594  O-methyltransferase family 2  21.41 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.147943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1214  tetracenomycin polyketide synthesis 8-o-methyltransferase, putative  28.09 
 
 		 333 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00996217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0086  putative O-methyltransferase  23.85 
 
 		 350 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2850  O-methyltransferase family 2  23.18 
 
 		 381 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.387298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>