More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8726 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4297  Glycine--tRNA ligase  60.98 
 
 
1024 aa  1132    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83812  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1038  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  63.5 
 
 
987 aa  1170    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2121  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  61.25 
 
 
1019 aa  1134    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1275  glycine--tRNA ligase  62.74 
 
 
1017 aa  1152    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.208463 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4496  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  58.83 
 
 
993 aa  1111    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.957039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8726  Glycine--tRNA ligase  100 
 
 
991 aa  1971    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29834  predicted protein  45.75 
 
 
1051 aa  831    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.93436  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0178  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, alpha/beta subunits  32.87 
 
 
1003 aa  524  1e-147  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0599  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.46 
 
 
688 aa  411  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487119  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2472  glycine--tRNA ligase  36.51 
 
 
695 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0180526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3372  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.52 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.173732  normal  0.25449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0656  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.25 
 
 
687 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70031e-23 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3047  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.35 
 
 
698 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.228214  normal  0.0284837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1733  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  40.12 
 
 
690 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4254  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.65 
 
 
690 aa  403  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3059  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.09 
 
 
687 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2445  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.09 
 
 
694 aa  398  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0579  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.54 
 
 
687 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0642  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.05 
 
 
687 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.91532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1022  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.18 
 
 
687 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.208045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1712  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.5 
 
 
702 aa  390  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00327927  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0485  glycine--tRNA ligase  37.88 
 
 
688 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0011  glycine--tRNA ligase  39.88 
 
 
693 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.466423 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2941  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.43 
 
 
686 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.125162  hitchhiker  0.000287233 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0006  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  38.62 
 
 
688 aa  382  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1515  glycine--tRNA ligase  34.67 
 
 
688 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0373  glycine--tRNA ligase  37.68 
 
 
691 aa  379  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.87078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0355  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  35.1 
 
 
690 aa  379  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1306  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  39.4 
 
 
701 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1385  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.12 
 
 
696 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.036221  normal  0.597652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0070  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.77 
 
 
689 aa  376  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.118047  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1734  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
291 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.424728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2033  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  37.21 
 
 
696 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00144588  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1061  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.26 
 
 
691 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0655  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.93 
 
 
292 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79988e-24 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0013  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.43 
 
 
684 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0578  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.49 
 
 
292 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3672  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.69 
 
 
688 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0142363  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4449  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.19 
 
 
689 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1052  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.09 
 
 
297 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0598  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.44 
 
 
290 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4959400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0741  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.38 
 
 
691 aa  367  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.143146  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.37 
 
 
684 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000133889  normal  0.112381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1305  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.19 
 
 
309 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3673  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.74 
 
 
291 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000113382  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4481  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.1 
 
 
719 aa  367  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.731924  normal  0.0858499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4167  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  37.05 
 
 
689 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3060  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
292 aa  366  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2942  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  60.14 
 
 
291 aa  366  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000870309  hitchhiker  0.000753437 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0023  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.9 
 
 
689 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3782  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.9 
 
 
689 aa  365  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3255  Glycine--tRNA ligase  37.66 
 
 
696 aa  365  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4130  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.9 
 
 
689 aa  365  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12440  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.8 
 
 
686 aa  365  3e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1023  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.44 
 
 
291 aa  365  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.165229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0604  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.15 
 
 
694 aa  365  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0641  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  59.44 
 
 
291 aa  365  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.963303  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1092  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  57.34 
 
 
293 aa  365  3e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11030  glycyl-tRNA synthetase, tetrameric type, beta subunit  35.63 
 
 
694 aa  365  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604533 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1115  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.43 
 
 
690 aa  364  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.217479  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2554  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.83 
 
 
701 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100286  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2210  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.1 
 
 
697 aa  363  8e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1207  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.74 
 
 
294 aa  363  9e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0202592  normal  0.156512 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2460  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.86 
 
 
326 aa  363  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.581203  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2473  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.34 
 
 
295 aa  363  1e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000559349  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00100  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.43 
 
 
685 aa  363  1e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00008  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.93 
 
 
692 aa  362  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0555063  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0060  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.23 
 
 
684 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4255  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.69 
 
 
296 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00424245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2650  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  38.68 
 
 
701 aa  362  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2555  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.53 
 
 
309 aa  361  4e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00956697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0992  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
289 aa  361  4e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2651  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.53 
 
 
309 aa  361  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3935  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  32.1 
 
 
680 aa  359  1.9999999999999998e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000397713  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0076  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.69 
 
 
683 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.589695  hitchhiker  0.000000000290731 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2034  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.99 
 
 
294 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000016391  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0603  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.74 
 
 
319 aa  358  2.9999999999999997e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1265  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.34 
 
 
289 aa  357  5e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.127189  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3726  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  34.74 
 
 
688 aa  357  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1320  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.39 
 
 
299 aa  357  7.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.797629  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1687  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
290 aa  356  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0323438 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4934  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  356  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.711684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3048  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  56.64 
 
 
296 aa  356  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0314071  normal  0.0184819 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1774  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  58.28 
 
 
329 aa  355  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0563652  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0009  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  35.23 
 
 
684 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000238485  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0079  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.55 
 
 
683 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248487  decreased coverage  0.0000000000235888 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03410  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0152  glycyl-tRNA synthetase, beta subunit  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4054  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3966  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0156  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3761  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.677293  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03361  hypothetical protein  36.03 
 
 
689 aa  355  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2211  glycyl-tRNA synthetase subunit alpha  57.14 
 
 
317 aa  354  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0061  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  36.9 
 
 
689 aa  353  5.9999999999999994e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2337  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.99 
 
 
711 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2388  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  33.99 
 
 
711 aa  354  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0270  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
679 aa  353  8e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0011  glycyl-tRNA synthetase subunit beta  34.79 
 
 
684 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3936  glycyl-tRNA synthetase, alpha subunit  55.59 
 
 
289 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.429438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>