70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7543 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7543  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  214  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4521  anti-sigma-factor antagonist  37.21 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0130827  decreased coverage  0.00053204 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4101  anti-anti-sigma factor  37.8 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.642799 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7890  anti-sigma-factor antagonist  31.18 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.737942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0811  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.97 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5206  anti-sigma-factor antagonist  35.23 
 
 		 115 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.373839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 102 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4483  anti-anti-sigma regulatory factor  29.67 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000247107  normal  0.911013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  27.38 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  32.18 
 
 		 116 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  29.91 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2070  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  30.23 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0391516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  31.96 
 
 		 117 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1682  anti-sigma-factor antagonist  25.27 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1055  anti-sigma-factor antagonist  34.48 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.37 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  25.77 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  26.8 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  24.53 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3493  anti-sigma-factor antagonist  34.57 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.892416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 109 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2833  anti-anti-sigma factor  27.78 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  21.74 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3997  anti-sigma-factor antagonist  33.73 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1431  anti-anti-sigma factor family protein  35.21 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0153  anti-anti-sigma factor  28.44 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4890  anti-sigma-factor antagonist  31.76 
 
 		 117 aa  42  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  30.23 
 
 		 114 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  30.85 
 
 		 131 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1481  anti-sigma-factor antagonist  33.75 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.979403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4407  anti-sigma-factor antagonist  29.27 
 
 		 127 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.508963  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  22.64 
 
 		 120 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  30.3 
 
 		 117 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  29.21 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7537  hypothetical protein  32.18 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0663  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0683  anti-sigma-factor antagonist  23.23 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3867  Anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  36.71 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0300049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  20.2 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  27.71 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  23.33 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  23.91 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0283  anti-sigma-factor antagonist  27.84 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  25.47 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3055  anti-sigma factor antagonist  37.7 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  28.75 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  35.85 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  20.83 
 
 		 138 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>