More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6290 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 
250 aa  487  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5577  oxidoreductase FAD-binding subunit  66.8 
 
 
261 aa  315  4e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3726  oxidoreductase FAD-binding region  62.92 
 
 
243 aa  304  7e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2269  oxidoreductase FAD-binding subunit  61.25 
 
 
252 aa  278  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  62.4 
 
 
255 aa  271  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.251741 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  56.85 
 
 
248 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3261  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  60.26 
 
 
244 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4092  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  53.25 
 
 
269 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0922  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  49.37 
 
 
247 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2080  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  48.95 
 
 
239 aa  182  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.7178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2402  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.5 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.560839  normal  0.32542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2125  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.86 
 
 
243 aa  172  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.122233 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0121  oxidoreductase FAD-binding region  41.18 
 
 
248 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5181  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.41 
 
 
234 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0231  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  62.68 
 
 
168 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.202422  hitchhiker  0.00485328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1056  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.08 
 
 
264 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0605  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.38 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0109  oxidoreductase FAD-binding region  45.71 
 
 
216 aa  145  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4471  oxidoreductase FAD-binding subunit  47.08 
 
 
233 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3398  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.92 
 
 
259 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.262822  normal  0.0102673 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0935  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  35.86 
 
 
251 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2611  oxidoreductase FAD-binding subunit  42.38 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.124004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  33.73 
 
 
358 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3274  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.79 
 
 
358 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.60541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2485  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.27 
 
 
358 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.960936  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4465  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  38.03 
 
 
699 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.211507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1564  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.44 
 
 
348 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.517649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1085  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.17 
 
 
702 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2635  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.58 
 
 
358 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.0570519 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0195  oxidoreductase  31.97 
 
 
597 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3699  globin  27.91 
 
 
393 aa  95.5  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3091  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.29 
 
 
357 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.255521  hitchhiker  0.000372207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4186  ferredoxin  34.19 
 
 
346 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2973  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.73 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4042  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  33.47 
 
 
375 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03005  Phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  23.89 
 
 
349 aa  92.8  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0404  oxidoreductase, NAD/FAD/2Fe-2S iron-sulfur cluster binding protein  24.14 
 
 
373 aa  92.4  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363299  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.38 
 
 
368 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2477  ferredoxin  33.88 
 
 
379 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.949989 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4030  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  31.49 
 
 
365 aa  91.3  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3326  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  32.69 
 
 
687 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.41 
 
 
690 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1048  ferredoxin  26.78 
 
 
350 aa  90.5  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6652  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  28.81 
 
 
688 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640624  normal  0.369043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.19 
 
 
375 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2468  ferredoxin  32.48 
 
 
344 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7195  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  31.3 
 
 
358 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.601931  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3210  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  32.24 
 
 
362 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1265  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  27.39 
 
 
338 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  30.4 
 
 
402 aa  89.4  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1107  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.37 
 
 
700 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3715  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.49 
 
 
467 aa  89  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.437326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3747  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.34 
 
 
375 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.225631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.33 
 
 
585 aa  88.6  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3520  ferredoxin  31.28 
 
 
351 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  32.07 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3631  putative phenol hydroxylase (phenol 2-monooxygenase P5 component)  31.08 
 
 
356 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.411014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3076  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  28.9 
 
 
352 aa  87.8  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.163455 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00340  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  25.83 
 
 
585 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  36.02 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3712  ferredoxin  32.49 
 
 
339 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.709133  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1127  oxidoreductase FAD-binding region  26.77 
 
 
711 aa  87.4  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.99 
 
 
684 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4896  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  33.48 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.699955 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3785  ferredoxin  32.49 
 
 
339 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870039  normal  0.280135 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1052  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.76 
 
 
397 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.705726  normal  0.0721497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4405  benzoate 1,2-dioxygenase ferredoxin reductase subunit  29.92 
 
 
339 aa  86.7  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2763  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  31.91 
 
 
675 aa  87  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3373  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase PaaK subunit  31.12 
 
 
361 aa  87  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  32.79 
 
 
353 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5689  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-like, FMN-binding  31.6 
 
 
676 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1895  nitric oxide dioxygenase  29.63 
 
 
419 aa  86.3  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00231107  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3637  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  30.71 
 
 
365 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.206041 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.38 
 
 
669 aa  85.9  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  31.05 
 
 
402 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3725  ferredoxin  32.07 
 
 
339 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  31.54 
 
 
684 aa  85.5  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5717  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  36.19 
 
 
369 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  34.16 
 
 
367 aa  85.1  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05340  phenylacetate-CoA oxygenase, PaaK subunit  25.31 
 
 
357 aa  85.1  9e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000116603  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4002  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  32.08 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.924171  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3949  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  29.17 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  27.94 
 
 
681 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  28.03 
 
 
393 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  28.92 
 
 
402 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1401  ferredoxin  33.19 
 
 
363 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.734852  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  28.92 
 
 
402 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2882  oxidoreductase FAD-binding subunit  32.78 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.07552  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  28.92 
 
 
399 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  28.92 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6093  oxidoreductase FAD-binding subunit  28.57 
 
 
929 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372916  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1627  oxidoreductase FAD-binding subunit  35.16 
 
 
346 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0093  putative NADH oxidoreductase; putative nitric oxide dioxygenase  30.83 
 
 
670 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.303734 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1068  oxidoreductase FAD-binding subunit  31.49 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.570837  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1353  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.74 
 
 
848 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.155715  normal  0.293689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2130  ferredoxin  27.16 
 
 
361 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.896649  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5350  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.2 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.213773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4685  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  33.06 
 
 
687 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3372  oxidoreductase FAD-binding subunit  33.46 
 
 
369 aa  82.8  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.34 
 
 
402 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>