More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5497 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2900  Catalase  65.78 
 
 
550 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.478184  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2447  Catalase  85.06 
 
 
554 aa  986    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000105743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2125  Catalase  78.91 
 
 
555 aa  890    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.935253  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2940  catalase  63.3 
 
 
546 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.741864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2914  catalase  63.09 
 
 
546 aa  641    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2865  catalase  63.09 
 
 
546 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3172  catalase  63.3 
 
 
546 aa  643    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5249  Catalase domain protein  64.27 
 
 
529 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3534  Catalase  63.47 
 
 
530 aa  642    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0141383  normal  0.499891 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0865  Catalase  77.74 
 
 
551 aa  870    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.156858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3164  catalase  63.3 
 
 
546 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0632  catalase  63.47 
 
 
529 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.22011 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2728  catalase  63.81 
 
 
543 aa  671    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3405  Catalase  60.98 
 
 
529 aa  640    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.126746  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5497  Catalase  100 
 
 
552 aa  1143    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0993453  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3210  catalase  63.47 
 
 
530 aa  642    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.161662  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3182  catalase  63.09 
 
 
546 aa  644    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3285  catalase  64.14 
 
 
529 aa  649    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541509  normal  0.266272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0020  Catalase  83.36 
 
 
552 aa  963    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0935072 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1236  catalase  49.79 
 
 
488 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1076  catalase  49.79 
 
 
488 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000180402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1057  catalase  49.79 
 
 
488 aa  481  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000265108  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1055  catalase  49.79 
 
 
488 aa  481  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000319669  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1312  catalase  49.79 
 
 
488 aa  479  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1159  catalase  49.79 
 
 
488 aa  481  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0442603  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0874  catalase  49.79 
 
 
488 aa  478  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000610076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4132  catalase  49.59 
 
 
488 aa  475  1e-132  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000220587  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1209  catalase  49.38 
 
 
488 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00159652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1058  catalase  49.59 
 
 
488 aa  474  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1261  catalase  51.54 
 
 
449 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000453157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0523  catalase  46.78 
 
 
504 aa  436  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.903425  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0814  catalase  46.71 
 
 
505 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0893  catalase  45.38 
 
 
489 aa  429  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0721  catalase  44.24 
 
 
705 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5248  catalase  44.99 
 
 
735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.405546  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1662  Catalase  44.14 
 
 
705 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.768308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0617  catalase  44.53 
 
 
710 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4123  catalase  46.32 
 
 
705 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.283917  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1581  catalase hydroperoxidase HpiI oxidoreductase  44.11 
 
 
509 aa  405  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4216  Catalase  43.58 
 
 
700 aa  403  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1374  catalase  46.17 
 
 
511 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.547458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1465  Catalase  43.99 
 
 
704 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12821  normal  0.432634 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01967  Catalase  43.49 
 
 
689 aa  401  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.650017  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1223  catalase  45.96 
 
 
516 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0411942  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2604  catalase  45.96 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1165  catalase  43.85 
 
 
693 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5254  catalase  43.14 
 
 
517 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0289  catalase  44.47 
 
 
490 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.745578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4238  catalase  45.64 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0190  catalase  45.96 
 
 
505 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4722  catalase  43.6 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.356848 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1461  catalase  45.96 
 
 
511 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.627836  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0481  catalase  43.18 
 
 
479 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000437674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3353  catalase  43.6 
 
 
510 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.023683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5053  catalase-like  43.92 
 
 
484 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.272262  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0365  Catalase  43.7 
 
 
490 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.357048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02830  catalase  43.74 
 
 
507 aa  398  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0514  catalase  42.98 
 
 
479 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0447892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0032  catalase  42.66 
 
 
485 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00175553  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0253  catalase  43.48 
 
 
506 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0973  Catalase  42.4 
 
 
515 aa  393  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4886  catalase-like  42.48 
 
 
512 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1515  catalase  45.53 
 
 
799 aa  394  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1356  catalase  42.83 
 
 
704 aa  393  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0250  catalase  43.31 
 
 
506 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0766  catalase  42.55 
 
 
688 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0590  catalase  44.1 
 
 
794 aa  393  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2010  Catalase  45.49 
 
 
808 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0333  Catalase  43.66 
 
 
490 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.90897  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5326  catalase C  43.17 
 
 
718 aa  392  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3582  catalase  43 
 
 
510 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67763  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0510  catalase  42.68 
 
 
479 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.049218  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4522  catalase  42.59 
 
 
481 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5492  Catalase  43.62 
 
 
690 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.217923  normal  0.0437244 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11433  catalase HPII  41.07 
 
 
713 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3625  catalase  45.86 
 
 
705 aa  392  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0284483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3732  Catalase  45.62 
 
 
705 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2779  Catalase  44.22 
 
 
498 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0604  Catalase  43.09 
 
 
718 aa  391  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.0291393 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1188  catalase  42.31 
 
 
567 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3160  hydroperoxidase II  43.89 
 
 
709 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2949  catalase  43.89 
 
 
709 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962169  normal  0.093907 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1812  catalase HPII  41.71 
 
 
675 aa  388  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.648865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3597  Catalase  43.51 
 
 
694 aa  386  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3251  catalase  41.91 
 
 
527 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3481  Catalase  45.49 
 
 
720 aa  387  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2836  catalase  41.48 
 
 
711 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.339115  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02109  catalase  45.02 
 
 
701 aa  385  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.75009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36810  hydroperoxidase II  44.09 
 
 
709 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1830  catalase  44.31 
 
 
848 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.262631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3310  catalase  45.24 
 
 
702 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1040  catalase  44.67 
 
 
710 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0689912  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2380  catalase  44.67 
 
 
710 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00903929  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0125  catalase  42.48 
 
 
504 aa  385  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2003  catalase  44.07 
 
 
728 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5844  Catalase  41.8 
 
 
493 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.453783  normal  0.956183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2662  Catalase  45.24 
 
 
702 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0501  Catalase  42.86 
 
 
728 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3137  catalase  42.54 
 
 
507 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140497  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0211  catalase  42.57 
 
 
701 aa  379  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.247073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>