49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5148 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  72.06 
 
 		 200 aa  300  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  73.04 
 
 		 199 aa  268  4e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  68.69 
 
 		 198 aa  248  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  60.2 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.42 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  24.88 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.83 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  25.57 
 
 		 340 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.48 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 245 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.85 
 
 		 427 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 440 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.97 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  20.11 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.97 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.97 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  22.89 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  22.09 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  22.09 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  23.92 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  25.5 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.33 
 
 		 378 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  26.46 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  39.02 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.03 
 
 		 442 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  24.51 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 		 274 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  25.15 
 
 		 311 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.04 
 
 		 442 aa  41.6  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 228 aa  42  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.11 
 
 		 442 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.89 
 
 		 442 aa  41.2  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>