More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4725 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 332 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  59.38 
 
 		 328 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  57.28 
 
 		 352 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  55.21 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  52.63 
 
 		 327 aa  324  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  53.47 
 
 		 337 aa  323  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2471  transcriptional regulator, AraC family  55.86 
 
 		 327 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.117682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  55.56 
 
 		 339 aa  315  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 327 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  51.42 
 
 		 330 aa  312  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6224  AraC family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 367 aa  305  7e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  50.31 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  54.55 
 
 		 322 aa  279  5e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  47 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 350 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  46.52 
 
 		 348 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  45.14 
 
 		 313 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4142  transcriptional regulator, AraC family  48.06 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00637596  normal  0.887483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  45.4 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2133  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 314 aa  252  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 		 306 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  47.94 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 325 aa  252  7e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 333 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 340 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  43.77 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2855  AraC family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 258 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 356 aa  246  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  44.55 
 
 		 329 aa  245  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 320 aa  245  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  44.48 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  45.17 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 318 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  42.59 
 
 		 326 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4139  ThiJ/PfpI domain protein  43.85 
 
 		 321 aa  241  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 333 aa  241  9e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  44.1 
 
 		 333 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  43.7 
 
 		 346 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 335 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 335 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  43.91 
 
 		 322 aa  238  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  42.28 
 
 		 338 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  43.3 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  44.51 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  42.2 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  42.17 
 
 		 333 aa  235  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.85 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  46.82 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 341 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 315 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  40 
 
 		 329 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 315 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4236  transcriptional regulator, AraC family  41.99 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  40.39 
 
 		 316 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  41.53 
 
 		 333 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  38.98 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  39.51 
 
 		 333 aa  229  7e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1857  transcriptional regulator, AraC family  43.45 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.114565  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  37.9 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  42.59 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  40.79 
 
 		 344 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  41.72 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0051  transcriptional regulator  38.07 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.929929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  41.01 
 
 		 322 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0419  arac-family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000111496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  40.57 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>