238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4048 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4048  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173399  decreased coverage  0.000882934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1716  hypothetical protein  64.56 
 
 
206 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2757  hypothetical protein  57.07 
 
 
213 aa  214  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3045  protein of unknown function UPF0029  50 
 
 
211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5318  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.63 
 
 
211 aa  210  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5641  hypothetical protein TIGR00257  46.63 
 
 
211 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.989891  hitchhiker  0.000000000000266179 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5287  conserved hypothetical protein TIGR00257  46.15 
 
 
211 aa  208  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000948336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4891  hypothetical protein  46.15 
 
 
211 aa  208  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4876  hypothetical protein  46.15 
 
 
211 aa  208  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5305  hypothetical protein  45.67 
 
 
211 aa  208  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4991  hypothetical protein  46.15 
 
 
211 aa  206  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5363  conserved hypothetical protein TIGR00257  45.67 
 
 
211 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5046  hypothetical protein  45.67 
 
 
211 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5431  hypothetical protein  45.67 
 
 
211 aa  204  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3734  hypothetical protein  45.67 
 
 
212 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5502  protein of unknown function UPF0029  56.22 
 
 
209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3242  protein of unknown function UPF0029  48.76 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0084  protein of unknown function UPF0029  47.57 
 
 
212 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17110  hypothetical protein  47.09 
 
 
212 aa  165  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.46381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0361  hypothetical protein  44.2 
 
 
210 aa  159  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0415  hypothetical protein  42.78 
 
 
213 aa  158  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06100  conserved hypothetical protein TIGR00257  47.89 
 
 
210 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1191  hypothetical protein  38.95 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.952586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2068  hypothetical protein  50.25 
 
 
232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0096752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1444  hypothetical protein  43.75 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0134  protein of unknown function UPF0029  36.71 
 
 
207 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000670968  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1806  protein of unknown function UPF0029  47.47 
 
 
233 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000629698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0054  protein of unknown function UPF0029  49.74 
 
 
206 aa  147  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00609862 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0246  hypothetical protein  38.02 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18640  hypothetical protein  51.26 
 
 
231 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.685754  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2078  hypothetical protein  38.83 
 
 
219 aa  143  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3185  hypothetical protein  50 
 
 
199 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0320756  hitchhiker  0.00000000052125 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11160  conserved hypothetical protein TIGR00257  48.17 
 
 
233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.9655  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1280  protein of unknown function UPF0029  46.78 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.313223  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0335  hypothetical protein  40.45 
 
 
214 aa  132  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0180  protein of unknown function UPF0029  37.38 
 
 
216 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.190284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0789  hypothetical protein  42.49 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0502356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0772  hypothetical protein  42.49 
 
 
213 aa  131  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540579  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0405  hypothetical protein  35.36 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0899  protein of unknown function UPF0029  46.03 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000186376  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1318  hypothetical protein  34.74 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0492765  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1335  hypothetical protein  34.87 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000275512  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3177  protein of unknown function UPF0029  45.55 
 
 
274 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2891  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  125  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.373114  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3745  hypothetical protein  43.83 
 
 
204 aa  123  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00302159  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0023  hypothetical protein  44.29 
 
 
198 aa  122  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1241  hypothetical protein  37.87 
 
 
197 aa  122  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0035  hypothetical protein  39.01 
 
 
198 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127558  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0264  hypothetical protein  35.53 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00131939  normal  0.0250602 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0030  hypothetical protein  36.87 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000164661  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0960  hypothetical protein  44.93 
 
 
219 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239073  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3899  hypothetical protein  40.74 
 
 
204 aa  118  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00283954  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2192  hypothetical protein  36.26 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1310  hypothetical protein  48.15 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00619746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1725  protein of unknown function UPF0029  36.5 
 
 
204 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2434  hypothetical protein  38.42 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206546  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12020  conserved hypothetical protein TIGR00257  49.17 
 
 
208 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001987  hypothetical protein  43.36 
 
 
207 aa  115  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4042  hypothetical protein  39.51 
 
 
203 aa  115  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0955788  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1183  hypothetical protein  42 
 
 
200 aa  115  5e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5286  protein of unknown function UPF0029  40.1 
 
 
196 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3126  hypothetical protein  37.24 
 
 
209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00461  hypothetical protein  46.15 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1558  protein of unknown function UPF0029  38.89 
 
 
203 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1379  hypothetical protein  40.24 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.262935  normal  0.051322 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0733  hypothetical protein  38.17 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000337539  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1630  protein of unknown function UPF0029  38 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329042  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2244  hypothetical protein  38 
 
 
222 aa  111  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2481  hypothetical protein  35.47 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2174  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  111  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.279701  normal  0.249309 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0876  protein of unknown function UPF0029  35.79 
 
 
203 aa  111  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.196068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1793  protein of unknown function UPF0029  49.68 
 
 
215 aa  111  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2225  protein of unknown function UPF0029  40.62 
 
 
195 aa  111  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1554  protein of unknown function UPF0029  39.06 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03138  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4232  hypothetical protein  37.36 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0996008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2211  hypothetical protein  33.66 
 
 
217 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1989  protein of unknown function UPF0029  38.58 
 
 
212 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0499  hypothetical protein  44.53 
 
 
218 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000766856  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl056  putative proline dipeptidase  41.6 
 
 
232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1923  hypothetical protein  34.31 
 
 
217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0111  protein of unknown function UPF0029  33.94 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0944  hypothetical protein  40.86 
 
 
242 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.404461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3475  protein of unknown function UPF0029  36.92 
 
 
194 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0258  proline dipeptidase  39.52 
 
 
195 aa  107  9.000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.217199  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3825  hypothetical protein  40.13 
 
 
245 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366225  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0813  protein of unknown function UPF0029  30.51 
 
 
206 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3817  hypothetical protein  36.93 
 
 
212 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal  0.106539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3148  protein of unknown function UPF0029  36.98 
 
 
194 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1450  hypothetical protein  36.56 
 
 
198 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0314  hypothetical protein  32.37 
 
 
205 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.55405 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3042  hypothetical protein  36.46 
 
 
200 aa  106  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1076  protein of unknown function UPF0029  33.54 
 
 
192 aa  107  2e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4229  hypothetical protein  35.87 
 
 
204 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000219511  normal  0.021598 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3277  hypothetical protein  36.98 
 
 
195 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.78794  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2975  hypothetical protein  43.36 
 
 
204 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24840  hypothetical protein  41.51 
 
 
225 aa  105  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.070142  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1914  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  105  6e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00064118  normal  0.0316098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0285  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000001725  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3931  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  105  6e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.457043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>