172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4034 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4034  metalloprotease-like protein  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096293  normal  0.0588825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0662  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  36.32 
 
 
324 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6736  metalloprotease-like protein  34.3 
 
 
259 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2919  metalloprotease  33.19 
 
 
319 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6735  metalloprotease-like protein  32.33 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331634  normal  0.274801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4325  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  32 
 
 
319 aa  118  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4616  metalloprotease-like protein  29.66 
 
 
258 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.839032  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4326  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  34.22 
 
 
331 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2920  hypothetical protein  33.04 
 
 
322 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0930  metalloprotease-like protein  34.73 
 
 
341 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10350  predicted metalloprotease  33.9 
 
 
322 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.996596  normal  0.0302489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8759  hypothetical protein  31.3 
 
 
261 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1467  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  33.6 
 
 
358 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8699  hypothetical protein  26.75 
 
 
264 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3415  metalloprotease-like protein  28.99 
 
 
353 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154601  normal  0.658534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2115  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.5 
 
 
285 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4652  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.58 
 
 
297 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4657  metallopeptidase, zinc binding  31.58 
 
 
316 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4519  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.58 
 
 
296 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4913  hypothetical protein  30.17 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0109468  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0857  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.48 
 
 
302 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2367  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  31.3 
 
 
294 aa  89  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39378  normal  0.55814 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0447  putative neutral zinc metallopeptidase  29.92 
 
 
282 aa  89  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00964466  normal  0.614722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2846  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.04 
 
 
517 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2040  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.76 
 
 
284 aa  88.6  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1749  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.65 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.639669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1643  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.25 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.18536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0779  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.26 
 
 
294 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68402 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3136  hypothetical protein  26.97 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02367  hypothetical protein  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1194  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3697  hypothetical protein  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2606  hypothetical protein  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02329  hypothetical protein  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1201  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117986  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2622  hypothetical protein  29.33 
 
 
287 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25770  predicted metalloprotease  31.31 
 
 
312 aa  85.9  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2771  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.49 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0828  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.12 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1131  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.38 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.273334  normal  0.63653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1052  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.38 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5433  hypothetical protein  31.1 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1985  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.57 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.892752  normal  0.526462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3177  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.15 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2847  hypothetical protein  28.85 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62420  hypothetical protein  30.62 
 
 
297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2852  zinc protease  29.33 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2971  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.47 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1250  metalloprotease-like protein  26.56 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2755  hypothetical protein  28.85 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2154  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.08 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.214921  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1366  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.56 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0872  hypothetical protein  27.85 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0161081  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4657  zinc metallopeptidase, putative  27.71 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3871  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  31.98 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.198703 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4616  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.6 
 
 
282 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1057  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  28.45 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0568968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06840  predicted metalloprotease  33.82 
 
 
319 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.219653  normal  0.038026 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1515  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.29 
 
 
298 aa  82.8  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3317  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.91 
 
 
284 aa  82.8  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.655572  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2719  zinc protease  28.85 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.884525  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2745  zinc protease  28.85 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.592779  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2631  zinc protease  28.85 
 
 
287 aa  82.8  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07770  zinc metallopeptidase  28.63 
 
 
284 aa  82  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3506  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.87 
 
 
288 aa  82  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4289  hypothetical protein  28.07 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2725  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.15 
 
 
295 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.862724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2679  zinc protease  28.85 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2086  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.23 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10483  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3115  hypothetical protein  28.23 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0633629  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1876  hypothetical protein  31.34 
 
 
372 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.425514  normal  0.686194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2726  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  27.8 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4765  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.57 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3879  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.48 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1259  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.11 
 
 
311 aa  79  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.109389  normal  0.980751 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6586  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.77 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2503  hypothetical protein  30.52 
 
 
295 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0194422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1914  metalloprotease  26.52 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3482  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  30.77 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13420  predicted metalloprotease  29.02 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00442634  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2312  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  26.94 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000120651  normal  0.307835 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1722  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.45 
 
 
282 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0858  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.06 
 
 
347 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0459016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4615  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.87 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.237842 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4245  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.87 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.162984  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1485  hypothetical protein  27.57 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4074  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  26.43 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.126903  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4250  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  24.8 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0910  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  30.19 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0387284 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3535  hypothetical protein  32.11 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.995239 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2715  zinc metalloprotease  28.57 
 
 
310 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5347  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.7 
 
 
317 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1251  zinc protease  24.38 
 
 
292 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00055946  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4041  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.74 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000295256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2331  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  29.46 
 
 
295 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.88553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1850  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  28.11 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303807 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1147  protein of unknown function, zinc metallopeptidase putative  29.25 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0335  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.36 
 
 
281 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.340384  hitchhiker  0.00139185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1681  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  27.1 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.713078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4077  protein of unknown function zinc metallopeptidase putative  35.48 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.813823  normal  0.846843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>