81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3100 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3100  transcriptional regulator protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.219719  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5121  Transcriptional regulator-like protein  44.76 
 
 		 215 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0287  FMN-binding negative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  134  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00581464  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02790  transcriptional regulator  43.6 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2380  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.8 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1997  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.37 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3276  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0785112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3644  transcriptional regulator protein  31.37 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3253  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3265  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.51 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2953  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.51 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.636626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3032  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.51 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3283  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.41 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.896796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0091  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.05 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0096  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0976  FMN-binding negative transcriptional regulator  23.68 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3707  negative transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0908965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2431  negative transcriptional regulator  26.42 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3512  transcriptional regulator  26.89 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4259  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0220  FMN-binding negative transcriptional regulator  22.44 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3511  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.63 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0395  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.58 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0853  negative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0134  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.4 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.435875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3532  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  26.56 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0835  negative transcriptional regulator  33.07 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.971312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0092  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.6 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2937  negative transcriptional regulator  34.25 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0540  negative transcriptional regulator  27.98 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.05365  normal  0.138094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3982  negative transcriptional regulator  27.32 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3223  FMN-binding negative transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.690612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3311  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.62 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.262888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3526  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.62 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.02519 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3571  protease synthase and sporulation negative regulatory protein PAI 2  25.62 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0243  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.96 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0096  flavin-nucleotide-binding protein  21.88 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000283829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3225  transcriptional repressor of sporulation and protease synthase  25.62 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6892  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.84 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.199077  normal  0.214366 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5075  FMN-binding negative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2973  negative transcriptional regulator  24.75 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.325157 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6076  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.92 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2794  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3864  negative transcriptional regulator  34.42 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2595  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.55 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.596063  normal  0.387645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1658  negative transcriptional regulator  23.88 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0716  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1466  FMN-binding negative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2930  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.66 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3742  negative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5057  negative transcriptional regulator  29.45 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0073129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2440  negative transcriptional regulator  27.51 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0623285  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1405  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.22 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3464  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.272985 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4536  FMN-binding negative transcriptional regulator  26.2 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.856573 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5505  transcriptional regulator, putative  27.03 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2821  transcriptional regulator, putative  28 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0662  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.22 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3387  negative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3641  negative transcriptional regulator  25.99 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.691719  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4171  negative transcriptional regulator  28.67 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2824  negative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.200304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2334  negative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0188338  normal  0.0316275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2407  negative transcriptional regulator  24.38 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.103505 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4176  FMN-binding negative transcriptional regulator  33.12 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00181829  normal  0.167994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6596  FMN-binding negative transcriptional regulator  30.17 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127183  normal  0.105964 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2445  negative transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4489  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.03 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4616  negative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2487  negative transcriptional regulator  27.5 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.234096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09790  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1423  FMN-binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5392  FMN-binding negative transcriptional regulator  28.07 
 
 		 209 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104323 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1228  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0639  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1455  FMN-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0514  putative transcriptional regulator  27.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2223  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.22 
 
 		 227 aa  41.6  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5144  FMN-binding negative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.081926  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3062  transcriptional regulator, putative  27.04 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50195  predicted protein  24.48 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.273335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>