More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2797 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2797  putative amino acid transporter  100 
 
 		 474 aa  932    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  69.66 
 
 		 495 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  61.17 
 
 		 486 aa  586  1e-166  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1730  amino acid permease-associated region  67.1 
 
 		 481 aa  561  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.219428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  61.24 
 
 		 538 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  56.77 
 
 		 494 aa  514  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  59.62 
 
 		 500 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  53.63 
 
 		 481 aa  461  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  51.59 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12343  cationic amino acid transport integral membrane protein rocE  54.1 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  47.86 
 
 		 476 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0831  amino acid permease-associated region  46.79 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1720  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 471 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  48.08 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  47.75 
 
 		 466 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6732  amino acid transporter  44.51 
 
 		 489 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.156437  normal  0.210596 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  47.53 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  47.54 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  46.68 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  46.81 
 
 		 476 aa  385  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  46.88 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  46.88 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  46.88 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4455  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  42.61 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0208  amino acid permease  47.66 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  42.83 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4919  amino acid permease-associated region  41.75 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  46.07 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0424  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  42.18 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  44.07 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  44.07 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0230  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0242  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.557003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  43.83 
 
 		 471 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  46.07 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  45.62 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  45.84 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3289  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.549076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  44.44 
 
 		 465 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  46.07 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  45.62 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  44.04 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3392  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2954  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2134  amino acid permease  47.23 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  41.76 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0909  amino acid permease family protein  45.62 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  43.25 
 
 		 506 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  41.33 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  45.96 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0728  amino acid permease-associated region  45.84 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  46.88 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4969  amino acid permease-associated region  41.55 
 
 		 496 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0260765 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0207  amino acid permease-associated region  44.66 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3597  amino acid permease-associated region  40.9 
 
 		 549 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333154 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0872  amino acid permease family protein  45.84 
 
 		 467 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4463  amino acid permease family protein  45.39 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.821822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5815  amino acid permease-associated region  44.04 
 
 		 465 aa  363  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1341  amino acid permease-associated region  43.46 
 
 		 496 aa  362  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  40.68 
 
 		 495 aa  361  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  45.36 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  41.39 
 
 		 490 aa  359  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  45.49 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1408  cationic amino acid transporter  42.86 
 
 		 483 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0734654  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2013  amino acid permease-associated region  43.38 
 
 		 501 aa  356  5e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0943155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2919  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.236218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3152  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.496369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3141  amino acid permease family protein  39.83 
 
 		 471 aa  356  5.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.681445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0631  amino acid permease family protein  41.67 
 
 		 471 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.279847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  40.69 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  42.74 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  39.11 
 
 		 501 aa  354  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1465  amino acid permease-associated region  42.25 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1000  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 566 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  42.24 
 
 		 463 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3581  amino acid transport protein  41.08 
 
 		 480 aa  351  2e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0683236  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  42.03 
 
 		 463 aa  349  6e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0345  amino acid permease-associated region  42.95 
 
 		 468 aa  349  8e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4174  amino acid permease-associated region  41.58 
 
 		 478 aa  348  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  0.28467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0373  amino acid permease-associated region  44.97 
 
 		 463 aa  348  9e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2897  amino acid permease  39.61 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0279038  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  39.92 
 
 		 494 aa  345  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2857  amino acid permease-associated region  41.73 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  41.33 
 
 		 495 aa  343  4e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2042  phospholipid binding protein  40.48 
 
 		 525 aa  343  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2106  amino acid permease family protein  39.61 
 
 		 471 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3131  amino acid permease family protein  39.61 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3163  amino acid permease family protein  39.4 
 
 		 471 aa  342  7e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1168  amino acid transporter  40.93 
 
 		 478 aa  342  8e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0306264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1758  amino acid permease-associated region  44.53 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120604  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3677  amino acid permease-associated region  41.88 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  40.56 
 
 		 486 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2849  amino acid permease  39.4 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.714889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>