47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0184 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0184  cadmium resistance transporter, putative  100 
 
 		 189 aa  360  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0347  cadmium resistance transporter  69.68 
 
 		 211 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4210  cadmium resistance transporter  54.24 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4310  cadmium resistance transporter  54.24 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103075  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4479  cadmium resistance transporter  54.24 
 
 		 199 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2848  cadmium resistance transporter  38.07 
 
 		 212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.551645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0853  cadmium resistance transporter  42.61 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2457  cadmium resistance transporter  35.32 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000531137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2696  putative transport protein  35.32 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000223261 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5023  cadmium resistance transporter  35.03 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257452  normal  0.407908 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5025  cadmium resistance transporter  34.25 
 
 		 228 aa  105  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0241386  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1370  cadmium resistance family protein  34.69 
 
 		 205 aa  101  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.128389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4661  quaternary amine transporter  38.83 
 
 		 198 aa  98.2  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0897553 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0350  cadmium resistance transporter  35.08 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1265  cadmium resistance transporter, putative  32.49 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00419797  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4400  cadmium resistance transporter  32.04 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2221  cadmium resistance family protein  33.16 
 
 		 205 aa  95.1  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.242988  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2753  cadmium resistance transporter CadD  33.16 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0956067  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2796  cadmium resistance transporter CadD  33.16 
 
 		 205 aa  94.7  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2849  cadmium resistance transporter  33.33 
 
 		 238 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4404  cadmium resistance transporter  34.76 
 
 		 232 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2497  quaternary ammonium compound-resistance protein, C-terminal  35.21 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000463679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1438  cadmium resistance transporter CadD  33.33 
 
 		 204 aa  91.7  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.799585  normal  0.500244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2866  cadmium resistance transporter  34.54 
 
 		 249 aa  91.3  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000609266  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4467  cadmium resistance transporter  33.69 
 
 		 232 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000272706  normal  0.331556 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25750  predicted permease, cadmium resistance protein  36.56 
 
 		 198 aa  85.5  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4473  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.879748 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4410  cadmium resistance transporter  29.9 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20660  predicted permease, cadmium resistance protein  37.76 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25690  predicted permease, cadmium resistance protein  37.76 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4463  cadmium resistance transporter  30.67 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00350576  normal  0.203926 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2868  cadmium resistance transporter  35.94 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3642  cadmium resistance transporter  36.08 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3241  cadmium resistance transporter  35.6 
 
 		 199 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5227  cadmium resistance transporter  35.65 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.580258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3180  cadmium resistance transporter  37.76 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00474254  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2659  cadmium resistance transporter  39.38 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2205  cadmium resistance transporter  37.3 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0699  cadmium resistance transporter, CadD family  28.8 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000313403  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5745  cadmium resistance transporter  34.33 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4068  cadmium transporter  28.02 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3211  permease cadmium resistance protein-like protein  33.79 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0284266  normal  0.131465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4997  cadmium resistance transporter  26.32 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000622218  normal  0.209664 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4076  cadmium transporter  27.33 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.999785  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4909  cadmium resistance transporter  34.52 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0610  cadmium resistance transporter  38.33 
 
 		 139 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2208  permease, cadmium resistance protein  25.93 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>