98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1474 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1474  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1608  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  74.78 
 
 		 232 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0279147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1574  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  74.89 
 
 		 232 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.708396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2769  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  74.78 
 
 		 232 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568899  hitchhiker  0.000000360563 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2582  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.75 
 
 		 240 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2514  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.3 
 
 		 240 aa  329  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  hitchhiker  0.00085565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2680  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.49 
 
 		 237 aa  328  5.0000000000000004e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1775  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  68.14 
 
 		 223 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1585  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  73.27 
 
 		 209 aa  298  6e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.62 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1521  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  54.91 
 
 		 214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2702  hypothetical protein  52 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1203  hypothetical protein  51.6 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1297  hypothetical protein  49.32 
 
 		 192 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0676  Uracil-DNA glycosylase superfamily  46.15 
 
 		 202 aa  201  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.719077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0518  hypothetical protein  46.15 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002178  uracil-DNA glycosylase  45.21 
 
 		 190 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3131  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  44.34 
 
 		 192 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3380  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.62 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2058  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.69 
 
 		 194 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1872  hypothetical protein  46.12 
 
 		 199 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2718  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.62 
 
 		 221 aa  198  6e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00217  uracil-DNA glycosylase  44.29 
 
 		 190 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1099  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2706  Uracil DNA glycosylase family protein  46.36 
 
 		 224 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2858  uracil-DNA glycosylase  46.36 
 
 		 224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0288683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0845  hypothetical protein  42.48 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1828  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.47 
 
 		 198 aa  193  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134744  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4512  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.99 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0298657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3856  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.99 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2359  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.69 
 
 		 196 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000880507  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5792  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.99 
 
 		 199 aa  190  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4129  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.53 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0471  hypothetical protein  43.26 
 
 		 193 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.100032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1338  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.5 
 
 		 199 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0908  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.55 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0381  uracil DNA glycosylase superfamily protein  44.09 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.5 
 
 		 199 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1429  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.65 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  0.935298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4405  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.58 
 
 		 199 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2770  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  41.67 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2644  hypothetical protein  44.5 
 
 		 190 aa  186  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4142  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.24 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0519945 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0123  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.64 
 
 		 192 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4694  Uracil-DNA glycosylase superfamily  42.99 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2314  uracil-DNA glycosylase protein  41.81 
 
 		 210 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1928  hypothetical protein  43.36 
 
 		 225 aa  171  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2077  putative uracil-DNA glycosylase protein  41.63 
 
 		 210 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.807763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.38 
 
 		 199 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.848547  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2358  hypothetical protein  42.73 
 
 		 210 aa  168  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1333  hypothetical protein  42.79 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0861  hypothetical protein  40.76 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03584  uracil-DNA glycosylase  41.94 
 
 		 195 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4522  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.71 
 
 		 197 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5163  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.36 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231748  normal  0.418426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0869  hypothetical protein  40.76 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1797  Uracil-DNA glycosylase superfamily  43.3 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.804136  normal  0.0343118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0962  uracil-DNA glycosylase  38.57 
 
 		 196 aa  165  6.9999999999999995e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1081  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.67 
 
 		 178 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1518  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.93 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.8 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0358964  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3326  hypothetical protein  40.97 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0265  hypothetical protein  38.64 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.9997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1516  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.1 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827918  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03250  hypothetical protein  37.61 
 
 		 188 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1752  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.55 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4558  uracil-DNA glycosylase superfamily  38.74 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390923  normal  0.0967806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2054  hypothetical protein  38.79 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0915  Uracil-DNA glycosylase  36.53 
 
 		 191 aa  155  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.316176  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1598  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.44 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.641371  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2577  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.36 
 
 		 204 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0849  hypothetical protein  38.1 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401189  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1204  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.99 
 
 		 205 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1265  Uracil-DNA glycosylase superfamily  38.07 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1329  hypothetical protein  38.68 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A21  Uracil-DNA glycosylase  34.86 
 
 		 190 aa  149  3e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0588  uracil-DNA glycosylase superfamily  37.78 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3330  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  36.07 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.294993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00410  uracil-DNA glycosylase  36.16 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.61 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0412075  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1082  hypothetical protein  36.2 
 
 		 194 aa  141  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0656  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  35.09 
 
 		 200 aa  141  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2008  hypothetical protein  35.16 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3652  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.12 
 
 		 194 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1218  hypothetical protein  33.03 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1181  Uracil-DNA glycosylase superfamily  32.42 
 
 		 190 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1653  putative uracil-DNA glycosylase family protein  40 
 
 		 154 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000259009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0771  hypothetical protein  32.28 
 
 		 113 aa  69.3  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2711  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26.43 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.002461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.45 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0812  hypothetical protein  48.15 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0290024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1495  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.76 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  28.38 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0444  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.36 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00359006  normal  0.183299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3008  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.06 
 
 		 229 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2993  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.06 
 
 		 230 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3037  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.06 
 
 		 230 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.541371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2539  Uracil-DNA glycosylase superfamily  25.3 
 
 		 213 aa  41.6  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.523447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>