76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0812 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0812  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  170  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0290024  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3380  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  65.45 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  82.5 
 
 		 199 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.848547  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2718  Uracil-DNA glycosylase superfamily  65.45 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1872  hypothetical protein  70.21 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2058  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.08 
 
 		 194 aa  67  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4405  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  64 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2706  Uracil DNA glycosylase family protein  52.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4694  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.55 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0265  hypothetical protein  55.77 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.9997 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4558  uracil-DNA glycosylase superfamily  70.45 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390923  normal  0.0967806 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0381  uracil DNA glycosylase superfamily protein  73.81 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2858  uracil-DNA glycosylase  52.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0288683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0123  Uracil-DNA glycosylase superfamily  62 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4512  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0298657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4142  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0519945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5792  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1099  uracil-DNA glycosylase  52.24 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1338  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3856  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  62 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5163  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.83 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231748  normal  0.418426 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4129  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.9 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0845  hypothetical protein  57.14 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1828  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.06 
 
 		 198 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134744  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1297  hypothetical protein  62.22 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03584  uracil-DNA glycosylase  55.1 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0962  uracil-DNA glycosylase  54.72 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2769  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  57.78 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568899  hitchhiker  0.000000360563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1608  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  59.09 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0279147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1574  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  59.09 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.708396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0471  hypothetical protein  52.83 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.100032  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2644  hypothetical protein  50 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2770  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  61.9 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402973 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1585  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  57.78 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00217  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002178  uracil-DNA glycosylase  47.06 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3326  hypothetical protein  49.21 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1521  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.82 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03250  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1775  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  56.82 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0518  hypothetical protein  47.17 
 
 		 197 aa  57  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0676  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.719077 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2680  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.3 
 
 		 237 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1518  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 		 232 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2582  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  55.56 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3131  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  55.56 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1797  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.23 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.804136  normal  0.0343118 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1474  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  48.15 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2514  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  53.33 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  hitchhiker  0.00085565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0908  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1081  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  75 
 
 		 178 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4522  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.41 
 
 		 197 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3330  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.294993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1516  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50 
 
 		 220 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827918  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.25 
 
 		 208 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1329  hypothetical protein  59.52 
 
 		 198 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2054  hypothetical protein  44.64 
 
 		 211 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1752  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  49.09 
 
 		 205 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2359  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.27 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000880507  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2702  hypothetical protein  42.55 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1203  hypothetical protein  41.18 
 
 		 197 aa  50.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1265  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1204  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2077  putative uracil-DNA glycosylase protein  50 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.807763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2314  uracil-DNA glycosylase protein  48.08 
 
 		 210 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2577  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.43 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1429  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.48 
 
 		 208 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  0.935298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1333  hypothetical protein  60.61 
 
 		 183 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0656  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  41.82 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A21  Uracil-DNA glycosylase  41.18 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1598  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  39.06 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.641371  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1082  hypothetical protein  37.74 
 
 		 194 aa  43.9  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0849  hypothetical protein  37.93 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.88 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0358964  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3652  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.44 
 
 		 194 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>