101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2514 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2514  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  hitchhiker  0.00085565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2582  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  97.08 
 
 		 240 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2680  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  90.72 
 
 		 237 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1775  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  74.22 
 
 		 223 aa  345  3e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2769  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.49 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568899  hitchhiker  0.000000360563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1608  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.93 
 
 		 232 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0279147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1574  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.37 
 
 		 232 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.708396  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1474  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  71.3 
 
 		 228 aa  329  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1585  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  70.44 
 
 		 209 aa  295  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.01 
 
 		 208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1521  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  54.26 
 
 		 214 aa  250  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1203  hypothetical protein  55.05 
 
 		 197 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2702  hypothetical protein  53.92 
 
 		 200 aa  245  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1297  hypothetical protein  52.29 
 
 		 192 aa  223  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0676  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.77 
 
 		 202 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.719077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0518  hypothetical protein  49.77 
 
 		 197 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1872  hypothetical protein  49.55 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2058  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.91 
 
 		 194 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0471  hypothetical protein  46.05 
 
 		 193 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.100032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3131  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  46.98 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1828  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.33 
 
 		 198 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002178  uracil-DNA glycosylase  46.54 
 
 		 190 aa  208  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00217  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 190 aa  207  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2718  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.62 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2706  Uracil DNA glycosylase family protein  46.9 
 
 		 224 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1099  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2858  uracil-DNA glycosylase  46.9 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0288683  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3380  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.17 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5792  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.25 
 
 		 199 aa  202  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3856  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.25 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4512  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.25 
 
 		 199 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0298657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.12 
 
 		 199 aa  201  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1338  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.91 
 
 		 199 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2359  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.61 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000880507  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4405  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.12 
 
 		 199 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0381  uracil DNA glycosylase superfamily protein  45.58 
 
 		 224 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0908  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.55 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4142  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.66 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0519945 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4694  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.59 
 
 		 203 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4129  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.75 
 
 		 201 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2770  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  45.71 
 
 		 194 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1429  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.41 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  0.935298 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0123  Uracil-DNA glycosylase superfamily  44.04 
 
 		 192 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2644  hypothetical protein  43.58 
 
 		 190 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0845  hypothetical protein  41.96 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2358  hypothetical protein  44.3 
 
 		 210 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752899  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2077  putative uracil-DNA glycosylase protein  44.16 
 
 		 210 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.807763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2314  uracil-DNA glycosylase protein  43.86 
 
 		 210 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0869  hypothetical protein  43.67 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1928  hypothetical protein  43.39 
 
 		 225 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0861  hypothetical protein  43.23 
 
 		 213 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4522  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.47 
 
 		 197 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1333  hypothetical protein  43.28 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1797  Uracil-DNA glycosylase superfamily  45.58 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.804136  normal  0.0343118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1516  Uracil-DNA glycosylase superfamily  41.91 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827918  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0962  uracil-DNA glycosylase  41.1 
 
 		 196 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  42.5 
 
 		 169 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0358964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1518  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.44 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1752  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.38 
 
 		 205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1081  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.06 
 
 		 178 aa  172  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0265  hypothetical protein  42.2 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.9997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2577  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.05 
 
 		 204 aa  168  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.1 
 
 		 199 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.848547  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3326  hypothetical protein  41.99 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1204  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.99 
 
 		 205 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2054  hypothetical protein  41.3 
 
 		 211 aa  164  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1265  Uracil-DNA glycosylase superfamily  40.54 
 
 		 205 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5163  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.28 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231748  normal  0.418426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4558  uracil-DNA glycosylase superfamily  38.81 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390923  normal  0.0967806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1598  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40.43 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.641371  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0588  uracil-DNA glycosylase superfamily  42.27 
 
 		 202 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1329  hypothetical protein  40.95 
 
 		 198 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03584  uracil-DNA glycosylase  40.65 
 
 		 195 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0849  hypothetical protein  39.55 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03250  hypothetical protein  36.45 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3330  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  38.18 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.294993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0915  Uracil-DNA glycosylase  39.29 
 
 		 191 aa  152  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.316176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3652  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  40 
 
 		 194 aa  152  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A21  Uracil-DNA glycosylase  35.19 
 
 		 190 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0656  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.21 
 
 		 200 aa  148  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  37.9 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0412075  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2008  hypothetical protein  38.46 
 
 		 193 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1082  hypothetical protein  36.73 
 
 		 194 aa  137  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00410  uracil-DNA glycosylase  39.18 
 
 		 200 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188097 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1218  hypothetical protein  33.48 
 
 		 194 aa  131  9e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1181  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.51 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1653  putative uracil-DNA glycosylase family protein  37.93 
 
 		 154 aa  95.9  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000259009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0771  hypothetical protein  32.54 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2711  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.19 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.002461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0812  hypothetical protein  53.33 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0290024  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.41 
 
 		 297 aa  52.8  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  31.97 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1495  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.41 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1455  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.07 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108735  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07710  uracil-DNA glycosylase, family 4  24.83 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0444  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.8 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00359006  normal  0.183299 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4117  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.3 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00101771  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1056  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.18 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1253  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.03 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.269773  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  29.17 
 
 		 195 aa  42.4  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0226409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>