102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0471 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0471  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.100032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1297  hypothetical protein  63.44 
 
 		 192 aa  257  7e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1828  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.38 
 
 		 198 aa  252  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0676  Uracil-DNA glycosylase superfamily  63.98 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.719077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0518  hypothetical protein  63.98 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3131  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  58.64 
 
 		 192 aa  248  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2058  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  55.38 
 
 		 194 aa  244  6.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2359  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.85 
 
 		 196 aa  239  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000880507  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1429  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.38 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  0.935298 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00217  uracil-DNA glycosylase  51.89 
 
 		 190 aa  224  9e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002178  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 		 190 aa  222  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2706  Uracil DNA glycosylase family protein  55.91 
 
 		 224 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2770  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  52.41 
 
 		 194 aa  220  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402973 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1099  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2858  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 		 224 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0288683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1872  hypothetical protein  56.91 
 
 		 199 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0381  uracil DNA glycosylase superfamily protein  55.08 
 
 		 224 aa  218  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0908  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2644  hypothetical protein  51.35 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3856  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.05 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4512  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.05 
 
 		 199 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0298657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2680  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  47.39 
 
 		 237 aa  216  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4522  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.46 
 
 		 197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4129  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.87 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3380  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  57.98 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2718  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.98 
 
 		 221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5792  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.94 
 
 		 199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.48 
 
 		 199 aa  214  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4405  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.48 
 
 		 199 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1338  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.19 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2314  uracil-DNA glycosylase protein  55.1 
 
 		 210 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0845  hypothetical protein  53.48 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2514  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.05 
 
 		 240 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  hitchhiker  0.00085565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2582  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.05 
 
 		 240 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2077  putative uracil-DNA glycosylase protein  55.96 
 
 		 210 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.807763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1521  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  47.78 
 
 		 214 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2702  hypothetical protein  50.54 
 
 		 200 aa  211  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1775  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  46.12 
 
 		 223 aa  209  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4142  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.41 
 
 		 199 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0519945 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1203  hypothetical protein  52.79 
 
 		 197 aa  207  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.72 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1518  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.11 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1574  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  42.67 
 
 		 232 aa  201  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.708396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4694  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.34 
 
 		 203 aa  201  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1608  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.56 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0279147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2769  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  42.67 
 
 		 232 aa  201  7e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568899  hitchhiker  0.000000360563 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2054  hypothetical protein  52.36 
 
 		 211 aa  200  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0123  Uracil-DNA glycosylase superfamily  49.73 
 
 		 192 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1516  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.64 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827918  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1797  Uracil-DNA glycosylase superfamily  52.66 
 
 		 220 aa  199  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.804136  normal  0.0343118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1081  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.45 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3652  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.38 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5163  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.96 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231748  normal  0.418426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1752  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.4 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0265  hypothetical protein  51.06 
 
 		 223 aa  191  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.9997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03250  hypothetical protein  42.16 
 
 		 188 aa  191  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4558  uracil-DNA glycosylase superfamily  51.4 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390923  normal  0.0967806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1474  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.26 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2577  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.64 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.54 
 
 		 169 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0358964  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0656  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  51.79 
 
 		 200 aa  187  5e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0962  uracil-DNA glycosylase  45.74 
 
 		 196 aa  185  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1333  hypothetical protein  52.75 
 
 		 183 aa  185  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3330  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  47.09 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.294993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1265  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.15 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3326  hypothetical protein  48.54 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.93 
 
 		 199 aa  180  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.848547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1598  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.98 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.641371  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1204  Uracil-DNA glycosylase superfamily  47.62 
 
 		 205 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03584  uracil-DNA glycosylase  47.03 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2358  hypothetical protein  47.57 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752899  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0588  uracil-DNA glycosylase superfamily  46.35 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1928  hypothetical protein  47.24 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1329  hypothetical protein  49.44 
 
 		 198 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0869  hypothetical protein  46.86 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  45.96 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0412075  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0861  hypothetical protein  46.38 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1585  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.21 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0915  Uracil-DNA glycosylase  40.74 
 
 		 191 aa  167  8e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.316176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00410  uracil-DNA glycosylase  43.16 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188097 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A21  Uracil-DNA glycosylase  38.71 
 
 		 190 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1218  hypothetical protein  39.58 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0849  hypothetical protein  39.5 
 
 		 211 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401189  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1082  hypothetical protein  41.32 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2008  hypothetical protein  41.92 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1181  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.35 
 
 		 190 aa  138  6e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1653  putative uracil-DNA glycosylase family protein  46.62 
 
 		 154 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000259009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0771  hypothetical protein  39.8 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0812  hypothetical protein  52.83 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0290024  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2711  Uracil-DNA glycosylase superfamily  28.65 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.002461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2539  Uracil-DNA glycosylase superfamily  31.84 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.523447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0444  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00359006  normal  0.183299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  27.22 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0808  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2345  putative DNA polymerase  25.49 
 
 		 274 aa  45.1  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.191175  normal  0.189401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.57 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  25.47 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1495  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.06 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4084  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.72 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.81 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>