129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2770 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2770  1-(5-phosphoribosyl)-5-amino-4-imidazole- carboxylate (AIR) carboxylase  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2644  hypothetical protein  66.3 
 
 		 190 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  64.29 
 
 		 199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5792  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.59 
 
 		 199 aa  257  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3856  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.59 
 
 		 199 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4512  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.59 
 
 		 199 aa  257  8e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0298657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4405  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  64.29 
 
 		 199 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.212446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1338  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.74 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.382348 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4142  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  63.19 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0519945 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002178  uracil-DNA glycosylase  61.88 
 
 		 190 aa  251  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00217  uracil-DNA glycosylase  61.33 
 
 		 190 aa  251  6e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1099  uracil-DNA glycosylase  61.83 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2858  uracil-DNA glycosylase  61.83 
 
 		 224 aa  248  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0288683  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0381  uracil DNA glycosylase superfamily protein  60.96 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2706  Uracil DNA glycosylase family protein  61.29 
 
 		 224 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1297  hypothetical protein  58.82 
 
 		 192 aa  244  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.627102  normal  0.632291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2058  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.51 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4522  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  60.44 
 
 		 197 aa  238  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4129  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  58.29 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0908  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.84 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4694  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.05 
 
 		 203 aa  234  6e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.294521  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3131  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  54.01 
 
 		 192 aa  231  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.368422  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0123  Uracil-DNA glycosylase superfamily  54.4 
 
 		 192 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5163  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  59.34 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231748  normal  0.418426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2359  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  54.5 
 
 		 196 aa  224  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000880507  normal  0.472241 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0471  hypothetical protein  52.41 
 
 		 193 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.100032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1828  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.82 
 
 		 198 aa  219  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134744  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03250  hypothetical protein  51.38 
 
 		 188 aa  218  5e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.554703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0845  hypothetical protein  53.8 
 
 		 228 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.377436  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0676  Uracil-DNA glycosylase superfamily  55.98 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.719077 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0518  hypothetical protein  55.98 
 
 		 197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1872  hypothetical protein  53.76 
 
 		 199 aa  211  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.637506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2702  hypothetical protein  53.16 
 
 		 200 aa  209  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0962  uracil-DNA glycosylase  52.69 
 
 		 196 aa  207  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4558  uracil-DNA glycosylase superfamily  53.48 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.390923  normal  0.0967806 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4034  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  56.89 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0358964  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A21  Uracil-DNA glycosylase  54.55 
 
 		 190 aa  204  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2718  Uracil-DNA glycosylase superfamily  53.8 
 
 		 221 aa  202  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1218  hypothetical protein  50 
 
 		 194 aa  201  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.751449  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3380  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  53.01 
 
 		 221 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.22739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0265  hypothetical protein  52.08 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.9997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3644  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.54 
 
 		 199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.848547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0915  Uracil-DNA glycosylase  49.46 
 
 		 191 aa  197  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.316176  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2314  uracil-DNA glycosylase protein  52.88 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1203  hypothetical protein  50.52 
 
 		 197 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2514  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.71 
 
 		 240 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.992291  hitchhiker  0.00085565 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2582  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.24 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2680  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  45.24 
 
 		 237 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.131462 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1265  Uracil-DNA glycosylase superfamily  51.38 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267096  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1429  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal  0.935298 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2077  putative uracil-DNA glycosylase protein  51.24 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.807763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1082  hypothetical protein  48.4 
 
 		 194 aa  188  4e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1204  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.83 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0662658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1081  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  52.33 
 
 		 178 aa  187  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506052  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1329  hypothetical protein  51.4 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1474  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.67 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2008  hypothetical protein  51.52 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1516  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.7 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827918  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1775  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.58 
 
 		 223 aa  184  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1574  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.44 
 
 		 232 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.708396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2769  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  41.44 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0568899  hitchhiker  0.000000360563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1608  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  40.89 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0279147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1518  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.95 
 
 		 232 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.584042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1797  Uracil-DNA glycosylase superfamily  48.95 
 
 		 220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.804136  normal  0.0343118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3128  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.43 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3330  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  48.91 
 
 		 195 aa  181  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.294993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2054  hypothetical protein  46.04 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00410  uracil-DNA glycosylase  44.44 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.188097 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3326  hypothetical protein  50 
 
 		 225 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.238699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2577  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.73 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0518194 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1181  Uracil-DNA glycosylase superfamily  50.91 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1236  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.7 
 
 		 220 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0412075  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1521  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  43.41 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1752  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  46.32 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0588  uracil-DNA glycosylase superfamily  46.81 
 
 		 202 aa  174  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1598  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  44.55 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.641371  normal  0.405689 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03584  uracil-DNA glycosylase  48.07 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3652  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  50.31 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0869  hypothetical protein  44.33 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2358  hypothetical protein  44.06 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0656  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  43.3 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0861  hypothetical protein  43.84 
 
 		 213 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1333  hypothetical protein  46.33 
 
 		 183 aa  164  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1585  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  39.6 
 
 		 209 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0849  hypothetical protein  40.3 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0401189  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1928  hypothetical protein  46.47 
 
 		 225 aa  153  1e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1653  putative uracil-DNA glycosylase family protein  44.06 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000259009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0771  hypothetical protein  47.96 
 
 		 113 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2711  Uracil-DNA glycosylase superfamily  29.35 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.002461  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0812  hypothetical protein  61.9 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0290024  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01520  uracil-DNA glycosylase, family 4  31.82 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0226409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2784  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.81 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0335572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.68 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.92 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0444  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  29.48 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00359006  normal  0.183299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3092  uracil-DNA glycosylase  29.45 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00381992  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1809  DNA polymerase  23.85 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.7 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.67 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  29.38 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>