More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1495 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1495  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  100 
 
 
221 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2711  Uracil-DNA glycosylase superfamily  33.96 
 
 
198 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.002461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2539  Uracil-DNA glycosylase superfamily  37.5 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.523447  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0438  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.98 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0942  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  30.56 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1180  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.71 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5828  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.74 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3092  uracil-DNA glycosylase  34.34 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00381992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07331  Uracil-DNA glycosylase  28.4 
 
 
187 aa  64.3  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.444861  hitchhiker  0.00512235 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  36.84 
 
 
492 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0893  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.41 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0108  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.4 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1364  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6465  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.114604  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0503  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  37.74 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0413  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.13684  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6057  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.632041  normal  0.181537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11480  Uracil-DNA glycosylase  27.33 
 
 
210 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353711  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0795  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28 
 
 
219 aa  62.4  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0717  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.36 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.667137 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5462  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34 
 
 
219 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1286  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.94 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0466  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.3 
 
 
264 aa  62  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113584  hitchhiker  0.00887798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1838  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.51 
 
 
185 aa  61.6  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0259  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.84 
 
 
238 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382173  normal  0.0633983 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0411  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.59 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323475  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0426  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.59 
 
 
193 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000629945  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0372  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.95 
 
 
294 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000046016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2449  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.39 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0314  hypothetical protein  31.51 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.65 
 
 
186 aa  59.7  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000159527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3864  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.31 
 
 
327 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1297  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.71 
 
 
187 aa  59.7  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.13 
 
 
217 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.693226  normal  0.500254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3154  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.62 
 
 
201 aa  58.9  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4117  Uracil-DNA glycosylase superfamily  27.89 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00101771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5408  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.19 
 
 
244 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.937407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.87 
 
 
249 aa  58.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.133247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4084  Uracil-DNA glycosylase superfamily protein  32.54 
 
 
211 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0839  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.23 
 
 
297 aa  58.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0413074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4460  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.47 
 
 
207 aa  58.5  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1649  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.32 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00048269 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0333  hypothetical protein  30.14 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5631  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.67 
 
 
217 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609757  normal  0.0369434 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4431  phage SPO1 DNA polymerase-like protein  28.37 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.696718  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1937  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.71 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.090684  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5994  Uracil-DNA glycosylase superfamily  34.86 
 
 
546 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.263417 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1447  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.06 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0404  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.9 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.112864  normal  0.964796 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1244  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.73 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2276  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.71 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1500  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.94 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.43423  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2893  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.02 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.260893  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1777  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.87 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0444  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  33.62 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00359006  normal  0.183299 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0147  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.81 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4396  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.48 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  35.85 
 
 
496 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1204  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.02 
 
 
210 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0469279  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0440  uracil-DNA glycosylase  34.82 
 
 
275 aa  56.6  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3973  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.74 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3015  uracil-DNA glycosylase  32.34 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07281  Uracil-DNA glycosylase  26.25 
 
 
167 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1768  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.09 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3144  uracil-DNA glycosylase  29.06 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07481  Uracil-DNA glycosylase  25.62 
 
 
167 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2713  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  29.94 
 
 
484 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1393  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  34.31 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0551  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.13 
 
 
324 aa  55.8  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0957804 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0270  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.52 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  32.76 
 
 
491 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3405  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.96 
 
 
300 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1870  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0157  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.16 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0205394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3775  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.45 
 
 
273 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.858318  normal  0.0557135 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1870  Uracil-DNA glycosylase-like protein  27.33 
 
 
233 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00147256  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0356  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.11 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.606658  normal  0.0957243 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07301  Uracil-DNA glycosylase  26.25 
 
 
167 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2255  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30 
 
 
304 aa  55.1  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10497  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0437  uracil-DNA glycosylase, putative  28.47 
 
 
189 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0292507  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1364  putative DNA glycosylase  32.34 
 
 
218 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.77623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0379  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.37 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.3735  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1085  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.37 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.863324  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0675  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.25 
 
 
167 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3219  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
289 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1308  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  35.51 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0132537  normal  0.393253 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2515  Phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2009  phage SpO1 DNA polymerase-related protein  33.62 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0331799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1083  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.33 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.761546 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2338  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  31.37 
 
 
184 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000979927  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1210  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.93 
 
 
282 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  0.843697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1242  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  36.45 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.738609 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0113  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  28.74 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1169  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  28.88 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00763816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2121  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  33.02 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1479  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.71 
 
 
184 aa  53.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.242328  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2305  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  30.56 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0147899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2003  phage SPO1 DNA polymerase domain-containing protein  35.78 
 
 
433 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4076  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.74 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.134405  normal  0.334505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_379  uracil DNA glycosylase superfamily, DNA polymerase bacteriophage-type  34.34 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>