32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0588 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  716    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4338  hypothetical protein  43.06 
 
 		 342 aa  219  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3517  hypothetical protein  46.67 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.28634  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4301  hypothetical protein  44.98 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1898  hypothetical protein  41.52 
 
 		 306 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.879581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1663  hypothetical protein  37.39 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.997156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1466  hypothetical protein  35.13 
 
 		 303 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.390896  normal  0.161565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2215  hypothetical protein  32.75 
 
 		 217 aa  119  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.230677  normal  0.226796 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3591  hypothetical protein  47.67 
 
 		 284 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2717  hypothetical protein  27.02 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.237176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2494  hypothetical protein  27.02 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.336345 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2699  hypothetical protein  28.23 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0379527  normal  0.148969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2895  hypothetical protein  27.93 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0232978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11820  hypothetical protein  27.67 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3826  hypothetical protein  25.42 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2394  hypothetical protein  26.52 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2422  conserved hypothetical membrane spanning protein  26.18 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2985  hypothetical protein  24.08 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.519696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2157  hypothetical protein  27.49 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2442  hypothetical protein  29.35 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5382  hypothetical protein  32.64 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0213  hypothetical protein  30.96 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3815  hypothetical protein  33.72 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5683  hypothetical protein  37.5 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.167667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9044  hypothetical protein  36.21 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0742912  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1218  hypothetical protein  26.07 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4457  hypothetical protein  32.64 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5652  hypothetical protein  32.64 
 
 		 307 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.180197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1054  conserved hypothetical membrane spanning protein  31.94 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0955678 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3768  PhnA protein-like protein  35.14 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0532  hypothetical protein  31.55 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.198659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4778  hypothetical protein  33.8 
 
 		 207 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>