35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4739 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  66.34 
 
 		 205 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  67.34 
 
 		 221 aa  267  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 228 aa  267  8e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  63.11 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  62.14 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 378 aa  204  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  51.56 
 
 		 341 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  51.56 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 333 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 341 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  51.56 
 
 		 338 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0758.1  hypothetical protein  51.56 
 
 		 773 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 340 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  50.3 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  34.07 
 
 		 184 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 235 aa  42  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 190 aa  41.6  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 186 aa  41.6  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>