63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4736 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4736  response regulator receiver protein  100 
 
 		 283 aa  584  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.902902 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4900  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253372  normal  0.0964277 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3347  response regulator receiver protein  43.88 
 
 		 284 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390307 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1770  response regulator receiver protein  43.68 
 
 		 264 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000650767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.39338  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1361  hypothetical protein  42.5 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1283  hypothetical protein  42.5 
 
 		 302 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.902815  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1462  hypothetical protein  42.86 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1295  hypothetical protein  42.5 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1022  hypothetical protein  42.5 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0544  hypothetical protein  42.5 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0273  hypothetical protein  42.5 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.579161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4027  response regulator receiver protein  42.01 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4509  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4051  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606147  normal  0.806612 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4663  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.221008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1160  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 284 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5637  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal  0.35148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3705  response regulator receiver protein  41.32 
 
 		 284 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0784  response regulator receiver domain-containing protein  37.59 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0796  response regulator  37.59 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0635  response regulator receiver domain-containing protein  37.73 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0957  putative two-component transcriptional response regulator  37.59 
 
 		 291 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491452  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4146  response regulator receiver protein  36.53 
 
 		 303 aa  178  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3370  response regulator receiver protein  36.53 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4798  response regulator receiver protein  36.53 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5220  response regulator receiver protein  36.79 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2886  response regulator receiver protein  34.83 
 
 		 290 aa  168  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00546187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3304  response regulator receiver protein  34.69 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0549793  decreased coverage  0.00375163 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5147  response regulator receiver protein  35.21 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4051  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.821011 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0103  response regulator receiver protein  27.21 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.155156 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1004  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.09 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1073  two-component system response regulator transcription regulator protein  28.18 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139958  normal  0.232974 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0028  two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2404  two component transcriptional regulator  31.76 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0583  response regulator receiver domain-containing protein  29.35 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000029507  normal  0.0148942 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1603  transcriptional regulatory protein CpxR  32.93 
 
 		 226 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1393  transcriptional regulatory protein CpxR  32.93 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1355  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.454645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1316  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0954  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.605306  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  28.81 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  28.81 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1879  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1436  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1414  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4580  two component transcriptional regulator  25.2 
 
 		 234 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4943  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  23.77 
 
 		 236 aa  42.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0922  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2259  osmolarity response regulator  30.12 
 
 		 257 aa  42.4  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0634187  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0427  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 234 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2225  two component transcriptional regulator  31.13 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3881  winged helix family two component transcriptional regulator  31.25 
 
 		 237 aa  42.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1841  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2638  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.55029  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0736  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.632099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4162  OmpR-family response regulator  26.51 
 
 		 232 aa  42  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789041  normal  0.397671 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1686  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0151733  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1664  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1455  DNA-binding response regulator  25.2 
 
 		 242 aa  42.4  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>