112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3355 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3355  carbamoyltransferase  100 
 
 		 656 aa  1359    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.731341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1437  carbamoyltransferase  30.13 
 
 		 601 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5591  Carbamoyltransferase  29.21 
 
 		 585 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4499  Carbamoyltransferase  28.62 
 
 		 669 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2127  carbamoyltransferase  29.25 
 
 		 603 aa  204  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0359333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5039  Carbamoyltransferase  28.08 
 
 		 572 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.104774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1611  carbamoyltransferase  27.97 
 
 		 620 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3109  Carbamoyltransferase  28.09 
 
 		 606 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5247  carbamoyltransferase  26.86 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0144363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1622  carbamoyltransferase  28.29 
 
 		 618 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1277  Carbamoyltransferase  28.55 
 
 		 521 aa  193  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.360806  hitchhiker  0.000000532924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2644  carbamoyltransferase  28.87 
 
 		 545 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0141  carbamoyltransferase  26.12 
 
 		 563 aa  180  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4884  Carbamoyltransferase  33.87 
 
 		 609 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0433232 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3807  Carbamoyltransferase  33.87 
 
 		 609 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3391  nodulation protein nolNO  26.99 
 
 		 546 aa  177  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0422836  hitchhiker  0.00000000610765 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0623  carbamoyltransferase  26.73 
 
 		 578 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3426  Carbamoyltransferase  28.5 
 
 		 584 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4975  Carbamoyltransferase  27.8 
 
 		 547 aa  173  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0611  carbamoyltransferase  28.22 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0987274  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4385  carbamoyltransferase  28.09 
 
 		 599 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1710  carbamoyltransferase family protein  29.07 
 
 		 678 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5442  carbamoyltransferase  27.01 
 
 		 581 aa  171  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  0.0119956 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0127  carbamoyltransferase  26.05 
 
 		 567 aa  169  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000790061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3933  Carbamoyltransferase  28.09 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1383  carbamoyltransferase  27.24 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6446  carbamoyltransferase  27.24 
 
 		 581 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.043196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2445  Carbamoyltransferase  29.68 
 
 		 651 aa  163  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.263576  normal  0.154959 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6326  carbamoyltransferase  28.03 
 
 		 551 aa  163  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6037  carbamoyltransferase  27.08 
 
 		 581 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.652801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1569  Carbamoyltransferase  32.33 
 
 		 551 aa  161  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167984  normal  0.017158 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5650  carbamoyltransferase  26.53 
 
 		 581 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.278651  normal  0.277577 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6398  carbamoyltransferase  26.34 
 
 		 581 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.321918  normal  0.0555421 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0717  carbamoyltransferase  32.44 
 
 		 550 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0127723  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2162  putative carbamoyl transferase  27.82 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2007  carbamoyltransferase family protein  27.82 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.131787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2027  carbamoyltransferase family protein  27.82 
 
 		 573 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5073  Carbamoyltransferase  26.35 
 
 		 572 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11270  predicted carbamoyl transferase, NodU family  33.77 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.703235  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1673  carbamoyltransferase  26.58 
 
 		 511 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4291  Carbamoyltransferase  25.8 
 
 		 595 aa  153  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.200738  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4993  carbamoyltransferase  25.94 
 
 		 585 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2812  Carbamoyltransferase  32.92 
 
 		 621 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4944  carbamoyltransferase  25.77 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4816  carbamoyltransferase  25.77 
 
 		 585 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0524  carbamoyltransferase  25.77 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69975  normal  0.0948833 
 
 
-
 
NC_003296  RS01919  putative transferase protein  32.32 
 
 		 581 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.421944  normal  0.0166613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0586  carbamoyltransferase  25.24 
 
 		 584 aa  150  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.852931 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5930  carbamoyltransferase  28.81 
 
 		 594 aa  150  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_003296  RS03052  putative transferase protein  27.98 
 
 		 613 aa  149  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4992  carbamoyltransferase family protein  25.45 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0955  carbamoyltransferase  25.09 
 
 		 511 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1544  carbamoyltransferase  24.83 
 
 		 517 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0528  carbamoyltransferase  25.25 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66170  putative carbamoyl transferase  25.56 
 
 		 585 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0691162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0473  carbamoyltransferase  25.77 
 
 		 585 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5740  putative carbamoyl transferase  25.4 
 
 		 585 aa  147  9e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0315  carbamoyltransferase  31.27 
 
 		 619 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0240  carbamoyltransferase  25.52 
 
 		 509 aa  146  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1051  carbamoyltransferase  25.77 
 
 		 525 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.721213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44800  carbamoyltransferase  25.56 
 
 		 584 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17081  carbamoyltransferase  29.62 
 
 		 617 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3924  Carbamoyltransferase  31.61 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1640  nodulation protein nolNO, putative  31.8 
 
 		 592 aa  141  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.160965  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3055  Carbamoyltransferase  31.89 
 
 		 690 aa  142  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0921  carbamoyltransferase  27.04 
 
 		 588 aa  141  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3617  Carbamoyltransferase  31.49 
 
 		 589 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4254  Carbamoyltransferase  31.6 
 
 		 620 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0843761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4501  carbamoyltransferase  32.12 
 
 		 585 aa  140  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1988  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1387  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1011  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1299  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411991  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2275  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.771218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3169  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3040  carbamoyltransferase family protein  33.58 
 
 		 584 aa  140  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6292  Carbamoyltransferase  25.49 
 
 		 657 aa  140  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1163  nodulation protein nolNO, putative  24.75 
 
 		 584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0706  Carbamoyltransferase  26.57 
 
 		 587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389531  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3293  Carbamoyltransferase  28.67 
 
 		 633 aa  138  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328799  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3294  carbamoyltransferase  31.17 
 
 		 589 aa  137  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.998354 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43222  predicted protein  27.91 
 
 		 919 aa  137  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1487  3'-hydroxymethylcephem-O-carbamoyltransferase protein  30.51 
 
 		 523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.507378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3670  Carbamoyltransferase  25.29 
 
 		 541 aa  134  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.860984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3494  Carbamoyltransferase  31.17 
 
 		 589 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293425 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37440  predicted carbamoyl transferase, NodU family  27.61 
 
 		 605 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110816  normal  0.953761 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0978  carbamoyltransferase  25.19 
 
 		 623 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3193  Carbamoyltransferase  36 
 
 		 670 aa  130  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3660  carbamoyltransferase  26.46 
 
 		 563 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1557  carbamoyltransferase  30.21 
 
 		 618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.220611  normal  0.973124 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4991  carbamoyltransferase  28.07 
 
 		 383 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0258  Carbamoyltransferase  27.83 
 
 		 620 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7715  carbamoyltransferase  33.2 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.339505  normal  0.752206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0762  carbamoyltransferase  28.75 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.140253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2058  carbamoyltransferase  25.6 
 
 		 591 aa  124  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0108661  hitchhiker  0.0011172 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0524  carbamoyltransferase  30.56 
 
 		 622 aa  124  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1976  carbamoyltransferase  29.48 
 
 		 610 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3456  Carbamoyltransferase  27.51 
 
 		 619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4492  carbamoyl transferase NodU family-like protein  28.65 
 
 		 649 aa  122  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15921  hypothetical protein  32.49 
 
 		 600 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>