More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2913 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 278 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  67.87 
 
 		 283 aa  384  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4037  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATP binding protein  55.12 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3554  ABC dipeptide/oligopeptide/nickel transporter, ATP binding protein  55.12 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3689  ABC transporter related  55.12 
 
 		 292 aa  305  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  56.44 
 
 		 278 aa  303  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  55.85 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1797  ABC transporter related  56.25 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.169202  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1761  ABC transporter related  60 
 
 		 274 aa  288  7e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  51.12 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  50.75 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  49.63 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  50.55 
 
 		 279 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  49.63 
 
 		 277 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  50.93 
 
 		 274 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  51.67 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  50.93 
 
 		 274 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  50.55 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  48.52 
 
 		 285 aa  257  1e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  47.76 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  47.94 
 
 		 279 aa  256  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  48.72 
 
 		 280 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  49.63 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  46.82 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  48.82 
 
 		 287 aa  248  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  48.79 
 
 		 276 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  50 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  45.32 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  45.32 
 
 		 285 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  44.98 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  44.03 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  48.89 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  47.98 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  48.52 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  46.44 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  47.06 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  47.18 
 
 		 296 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  46.8 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0064  ABC transporter related  45.29 
 
 		 284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.080587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  45.52 
 
 		 276 aa  221  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  46 
 
 		 297 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.33 
 
 		 353 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.45 
 
 		 371 aa  217  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  47.69 
 
 		 276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2764  ABC transporter related  47.74 
 
 		 631 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0487  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.63 
 
 		 340 aa  215  7e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1185  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.36 
 
 		 328 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3600  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.24 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4157  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 338 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.55271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2766  ABC transporter related  46.99 
 
 		 301 aa  214  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7185  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  46.25 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2052  peptide ABC transporter ATP-binding protein  46.01 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.618151 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3883  ABC di/oligopeptide transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 		 338 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0133  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.63 
 
 		 328 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.829074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4352  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.3 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.907997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  42.91 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0848  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  44.61 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  42.91 
 
 		 334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1080  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  46.4 
 
 		 320 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 347 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 		 347 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1269  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.16 
 
 		 340 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0263793  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 347 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  46 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.13 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2359  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.04 
 
 		 342 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5709  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATP- binding protein  43.56 
 
 		 608 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0147492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  45.6 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 		 353 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 620 aa  210  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0983  ABC transporter related  42.35 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0278331  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  46.22 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2438  ABC transporter related  44.71 
 
 		 541 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3854  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.69 
 
 		 346 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.403514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3149  ABC transporter related protein  48.63 
 
 		 587 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  44.88 
 
 		 552 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.75 
 
 		 671 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  45.82 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1695  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000898255 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  45.82 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  45.82 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  45.82 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2225  ABC transporter related  45.83 
 
 		 532 aa  208  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.691472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 		 674 aa  208  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.734122 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3990  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 327 aa  208  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3235  ABC peptide transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3860  dipeptide transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  45.08 
 
 		 552 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>