More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1963 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1963  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 		 342 aa  663    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0528272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  67.54 
 
 		 341 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3263  inner-membrane translocator  69.59 
 
 		 341 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50300  ABC transporter permease  66.28 
 
 		 343 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4266  monosaccharide-transporting ATPase  64.69 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.525278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4182  inner-membrane translocator  58.63 
 
 		 341 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3854  Monosaccharide-transporting ATPase  58.93 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2822  monosaccharide-transporting ATPase  63.12 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3311  monosaccharide-transporting ATPase  61.56 
 
 		 341 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2928  monosaccharide-transporting ATPase  60.62 
 
 		 351 aa  358  9e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110864  normal  0.21378 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1682  inner-membrane translocator  58.93 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0233719  normal  0.330784 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7808  inner-membrane translocator  60.82 
 
 		 344 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.695038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4570  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  61.88 
 
 		 341 aa  345  8e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1889  monosaccharide-transporting ATPase  61.49 
 
 		 341 aa  344  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.94083  normal  0.398582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0055  inner-membrane translocator  59.06 
 
 		 363 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1306  inner-membrane translocator  60.87 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1345  monosaccharide-transporting ATPase  60.87 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0944  inner-membrane translocator  60.56 
 
 		 341 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.705108  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1426  inner-membrane translocator  60.56 
 
 		 341 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1404  monosaccharide-transporting ATPase  60.56 
 
 		 341 aa  342  7e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1243  sugar transmembrane ABC transporter protein  59.4 
 
 		 341 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.269264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  50.93 
 
 		 336 aa  273  5.000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  43.43 
 
 		 342 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  43.12 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  43.43 
 
 		 342 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  50 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  46.96 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  45.99 
 
 		 334 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  46.42 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  43.03 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  46.83 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 		 835 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  46.13 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  45.45 
 
 		 345 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  38.11 
 
 		 346 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22090  inner-membrane translocator  44.75 
 
 		 308 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  47.24 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2570  inner-membrane translocator  45.83 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  42.77 
 
 		 343 aa  212  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  41.43 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2998  inner-membrane translocator  40.75 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1339  inner-membrane translocator  40.37 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.698639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  41.98 
 
 		 317 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  43.37 
 
 		 320 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.81 
 
 		 331 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  42.12 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2045  inner-membrane translocator  43.89 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  43.17 
 
 		 342 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4236  ribose ABC transporter permease protein  44.52 
 
 		 322 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000913636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4526  ribose ABC transporter permease protein  44.52 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000584894  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  40.13 
 
 		 312 aa  205  7e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.97 
 
 		 350 aa  205  7e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1704  inner-membrane translocator  40.19 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.851457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.99 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1458  Monosaccharide-transporting ATPase  41.58 
 
 		 333 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0717887 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1550  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  45.1 
 
 		 342 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  43.24 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.99 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1343  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  45.1 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.854381  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0009  ribose ABC transporter permease protein  40.99 
 
 		 322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0799  beta-methylgalactoside transporter inner membrane component  41.81 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1370  ribose ABC transporter permease protein  41.78 
 
 		 323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.512196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  42.91 
 
 		 327 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  43.81 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  43.52 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  43.52 
 
 		 343 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  40.07 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  39.39 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  42.37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  41.9 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  42.37 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  41.69 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  40.58 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 311 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  40.26 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  40.26 
 
 		 311 aa  196  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  45.74 
 
 		 310 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  41.02 
 
 		 306 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  40.26 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  40.26 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  38.54 
 
 		 345 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 339 aa  195  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.8 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5186  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0679383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03636  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4217  Monosaccharide-transporting ATPase  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4266  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00636427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  37.65 
 
 		 333 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0516  ribose ABC transporter permease protein  41.69 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3966  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  41.08 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4899  ribose ABC transporter permease protein  42.96 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0818131  hitchhiker  0.000000774907 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4244  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00281805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4118  ribose ABC transporter permease protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03581  hypothetical protein  43.79 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>