More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3528 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  100 
 
 		 444 aa  919    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1749  ABC transporter related  38.55 
 
 		 253 aa  204  3e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2081  ABC transporter related  40.25 
 
 		 257 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0495  ABC transporter related  43.3 
 
 		 256 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0931596  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0509  iron compounds ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 256 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47160  ABC transporter  37.9 
 
 		 265 aa  186  6e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321704  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0446  ABC transporter related  37.07 
 
 		 266 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.435384  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26450  ABC transporter protein  37.5 
 
 		 264 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2739  ABC transporter related  37.87 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  39.11 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1095  ABC cobalamin/Fe3+-siderophores transporter, ATPase subunit  33.46 
 
 		 262 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.927351  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 265 aa  177  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 264 aa  177  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 266 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 253 aa  176  8e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1719  hypothetical protein  35.37 
 
 		 259 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.97888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0345  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4301  ABC transporter related  40 
 
 		 256 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0499  ABC transporter related  35.18 
 
 		 252 aa  173  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.367002  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0864  ABC transporter related  41.07 
 
 		 257 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0652  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 274 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0686  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 274 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4153  ABC transporter related  39.27 
 
 		 257 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0112212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1206  ABC transporter related  38.98 
 
 		 263 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1491  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.98 
 
 		 263 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3844  ABC transporter related  39.27 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.239665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0371  ABC transporter related  35.04 
 
 		 253 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.176524  normal  0.348572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0233  ABC transporter related  35.04 
 
 		 253 aa  172  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.51 
 
 		 270 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  33.86 
 
 		 258 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3258  iron ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.047532  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3096  ABC transporter  43.29 
 
 		 263 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.516576 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1464  ABC transporter related  36.51 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  39.42 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1134  ABC transporter related  37.92 
 
 		 250 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1423  ABC transporter related  37.29 
 
 		 260 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1490  ABC transporter related  34.52 
 
 		 253 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.771678  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1694  ABC transporter related  37.29 
 
 		 278 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.055567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1193  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 250 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1595  ABC transporter related  37.87 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2018  ABC transporter related  37.5 
 
 		 277 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0874  ABC transporter related  40.59 
 
 		 269 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0756  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.59 
 
 		 253 aa  168  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.737485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  38.3 
 
 		 275 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  38.3 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0407  ABC transporter related  33.73 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.430136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0430  ABC transporter related  33.73 
 
 		 253 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.591461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2223  ABC transporter related  33.9 
 
 		 259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.703062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0432  ABC transporter related  32.81 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4264  ABC transporter related  36.44 
 
 		 268 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0129332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1138  ABC transporter component  36.6 
 
 		 266 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.92157  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0814  putative iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 257 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00224462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  36.44 
 
 		 268 aa  166  9e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.18 
 
 		 251 aa  166  9e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0446  ABC transporter related  36.02 
 
 		 266 aa  166  9e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1543  ABC transporter related  38.4 
 
 		 262 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1166  putative vitamin B12 transport ATP-binding protein BtuD  35.69 
 
 		 276 aa  166  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.468222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  34.4 
 
 		 255 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  32.72 
 
 		 280 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2164  ABC transporter related  36.51 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  34.57 
 
 		 405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0496  ABC Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 256 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.863576  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0840  ABC transporter related  38.98 
 
 		 321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3182  ABC transporter related  38.98 
 
 		 321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3704  ABC transporter related  33.85 
 
 		 278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.591184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  34.13 
 
 		 290 aa  163  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  37.55 
 
 		 264 aa  162  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1927  ABC transporter related  39.83 
 
 		 262 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0701632 
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 272 aa  162  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  32.42 
 
 		 259 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1330  ABC transporter related  37.04 
 
 		 261 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.198336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.26 
 
 		 275 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0867  ABC transporter related  37.04 
 
 		 261 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.468249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1348  ABC transporter related  37.04 
 
 		 261 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.893482  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3280  ABC transporter related  38.56 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1284  ABC transporter related  37.39 
 
 		 276 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5021  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (iron)  38.02 
 
 		 384 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0722878  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2100  ABC transporter-related protein  37.3 
 
 		 262 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0027  ABC transporter-related protein  33.46 
 
 		 277 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0442  ABC transporter related  34.39 
 
 		 261 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  43.23 
 
 		 494 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2708  ABC transporter related  38.56 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0249  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 252 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0602  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.660447  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2006  ABC transporter related  38.56 
 
 		 245 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.105448  normal  0.245212 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 		 269 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0987  ABC transporter related  31.5 
 
 		 264 aa  160  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.343956  normal  0.294383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 256 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1993  ABC transporter related  31.3 
 
 		 269 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1172  iron ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 259 aa  160  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1120  ABC transporter related  33.33 
 
 		 260 aa  160  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000857475  hitchhiker  0.000000000136926 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  36.22 
 
 		 260 aa  160  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  34.77 
 
 		 268 aa  159  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  38.59 
 
 		 264 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2963  ABC transporter related  38.49 
 
 		 293 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1319  ABC transporter related  34.51 
 
 		 258 aa  159  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  38.46 
 
 		 262 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  37.6 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 259 aa  159  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0404  ABC transporter related  40.35 
 
 		 283 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>