42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6297 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_6297  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4838  hypothetical protein  51.85 
 
 		 286 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0387  putative ABC transporter integral membrane protein  37.92 
 
 		 296 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01660  hypothetical protein  36.27 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.584376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0928  putative ABC transporter membrane protein  34.56 
 
 		 294 aa  157  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.856372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1291  putative ABC transporter integral membrane protein  41.48 
 
 		 293 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.194463  hitchhiker  0.00415564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3426  hypothetical protein  39.85 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.448984  normal  0.248984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0608  putative ABC transporter integral membrane protein  37.13 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00037131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3300  putative ABC transporter membrane protein  39.18 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0749  hypothetical protein  35.79 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0856  ABC transporter membrane protein  35.71 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.705558  normal  0.0105527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0779  hypothetical protein  29.3 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5515  hypothetical protein  32.36 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5743  hypothetical protein  30.19 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.939168  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0297  hypothetical protein  28.83 
 
 		 299 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25850  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.573658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6527  ABC transporter integral membrane protein  29.11 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0483782  normal  0.177789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3028  hypothetical protein  29.12 
 
 		 307 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0101124  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0441  hypothetical protein  28.24 
 
 		 296 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1355  ABC transporter integral membrane protein  31.97 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6852  hypothetical protein  30.42 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0257  hypothetical protein  28.95 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.504314  normal  0.0342583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2323  hypothetical protein  26.64 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.242923  normal  0.300348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02370  hypothetical protein  23.46 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1810  bacitracin transport permease protein BcrB  25.96 
 
 		 326 aa  51.6  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367153  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1205  ABC transporter integral membrane protein  28.68 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2235  hypothetical protein  25.47 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2059  hypothetical protein  24.76 
 
 		 249 aa  48.9  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2486  hypothetical protein  39.73 
 
 		 326 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0512  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 274 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5097  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  35.21 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0462  hypothetical protein  31.34 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0357  copper ABC transporter, permease protein  27.59 
 
 		 283 aa  43.5  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5192  bacitracin transport permease protein BCRB  35.21 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5578  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5649  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5494  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5080  ABC transporter, permease; bacitracin transport permease  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0496537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5251  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 330 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5429  ABC transporter, permease protein  47.62 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5528  ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.891132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5522  ABC transporter, permease protein  33.8 
 
 		 330 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>