28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5648 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5649  hypothetical protein  49.07 
 
 
266 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal  0.0774344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3868  hypothetical protein  31.7 
 
 
267 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.665087  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0786  hypothetical protein  32.69 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0475585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0817  hypothetical protein  31.73 
 
 
229 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2300  hypothetical protein  29.86 
 
 
258 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0527677  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2262  hypothetical protein  28.29 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.123891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2299  hypothetical protein  28.5 
 
 
283 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38590  hypothetical protein  30.74 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5421  hypothetical protein  23.68 
 
 
261 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0285606  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0331  hypothetical protein  23.57 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3912  hypothetical protein  29.86 
 
 
277 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0260  hypothetical protein  25.14 
 
 
243 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1364  hypothetical protein  23.44 
 
 
248 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.361689  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0051  hypothetical protein  26.6 
 
 
330 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0950481  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6950  hypothetical protein  28.43 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5127  hypothetical protein  26.03 
 
 
236 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.309204  normal  0.127829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2093  hypothetical protein  28.31 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0793  hypothetical protein  26.71 
 
 
318 aa  45.8  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1932  hypothetical protein  22.22 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0974  hypothetical protein  23.77 
 
 
297 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3313  hypothetical protein  29.91 
 
 
337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.788444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2381  hypothetical protein  31.19 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000125152 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4387  hypothetical protein  28.72 
 
 
297 aa  42.4  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3530  hypothetical protein  25.77 
 
 
302 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3554  hypothetical protein  35.06 
 
 
318 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3622  hypothetical protein  35.06 
 
 
318 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0688  hypothetical protein  35.06 
 
 
318 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>