More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4925 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  794    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2754  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.622633  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  25.68 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 416 aa  116  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.88 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 440 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.84 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  24.57 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  24.93 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  24.21 
 
 		 415 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3945  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 421 aa  99  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 474 aa  96.3  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.93 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  24.38 
 
 		 431 aa  93.6  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.55 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 449 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  25 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  25.66 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  25.66 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 428 aa  86.7  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 390 aa  86.7  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  25.57 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  25.35 
 
 		 435 aa  83.6  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  27.5 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 524 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  25.29 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  25.29 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  24.64 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.37 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  31 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 417 aa  79.7  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 422 aa  79  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.46 
 
 		 403 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0380  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.41 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.25 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  26.12 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3139  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  26.98 
 
 		 464 aa  75.5  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 412 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  26.06 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.94 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  27.1 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  26.22 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  27.1 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.32 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  23.65 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4601  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621145  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  22.47 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  27.1 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  26.64 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>