96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3944 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
205 aa  407  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.87 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2390  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.14 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  34.1 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  35.77 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  35.77 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.9 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.1 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.73 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  34.83 
 
 
151 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  31.47 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  35.58 
 
 
155 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.46 
 
 
217 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.19 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.19 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
172 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.19 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  32.48 
 
 
137 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.59 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  31.03 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  27.01 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  36.05 
 
 
129 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.85 
 
 
159 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.47 
 
 
195 aa  59.3  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  36.05 
 
 
129 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.86 
 
 
191 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  31.13 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.82 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.19 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.48 
 
 
182 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  26.99 
 
 
169 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.65 
 
 
175 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.65 
 
 
168 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  31.13 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  32.56 
 
 
96 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  33.72 
 
 
129 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  30.46 
 
 
153 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  32.56 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  32.56 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  32.56 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  32.56 
 
 
129 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.28 
 
 
154 aa  54.7  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  32.14 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.43 
 
 
187 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  32.14 
 
 
155 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  32.14 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1891  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.86 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.277651  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  37.14 
 
 
129 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.16 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.41 
 
 
192 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.3 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  30.12 
 
 
175 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  31.4 
 
 
129 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2271  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.82 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237606  normal  0.0291339 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  33.96 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  31 
 
 
161 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.83 
 
 
163 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  27.88 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  27.88 
 
 
165 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.5 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  23.38 
 
 
158 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  28.57 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  30.19 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.7 
 
 
170 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.88 
 
 
206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.88 
 
 
206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.88 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0966  FxsA  32.33 
 
 
153 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.778639 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.71 
 
 
163 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  23.38 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.51 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.35 
 
 
184 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  29.9 
 
 
226 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  29.03 
 
 
211 aa  45.8  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.31 
 
 
158 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.64 
 
 
131 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  24.03 
 
 
167 aa  45.1  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.95 
 
 
197 aa  44.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.83 
 
 
130 aa  44.7  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3686  FxsA  42.39 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.22 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  25.97 
 
 
191 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2963  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.63 
 
 
193 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  40.62 
 
 
177 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  31.06 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.18 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 
196 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.37 
 
 
132 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  23.01 
 
 
129 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.41 
 
 
239 aa  42.4  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  26.85 
 
 
178 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.78 
 
 
168 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.98 
 
 
151 aa  42  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  22.3 
 
 
161 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  26.62 
 
 
172 aa  41.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>