102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1141 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1141  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 168 aa  326  8e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123046 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3110  FxsA cytoplasmic membrane protein  47.18 
 
 		 143 aa  107  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.778579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.71 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  33.92 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  31.48 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.6 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  27.98 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0008  hypothetical protein  35.14 
 
 		 177 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  29.87 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  29.87 
 
 		 165 aa  61.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.16 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.43 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  35.26 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.74 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.26 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.03 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.43 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.67 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.34 
 
 		 154 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.91 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.91 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.85 
 
 		 195 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.91 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.91 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.05 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  30.63 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  30.97 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  30.97 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  30.97 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.93 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.3 
 
 		 194 aa  51.2  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  28.39 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  34.38 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.52 
 
 		 187 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  28.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  28.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  28.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  28.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  28.48 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.91 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  35.14 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.14 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.19 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  33.68 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  28.47 
 
 		 177 aa  49.7  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  24.8 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.88 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.42 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.67 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.55 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  27.97 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.55 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.55 
 
 		 206 aa  48.1  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.55 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.48 
 
 		 159 aa  48.1  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.11 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.36 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  36.73 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.56 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  28.71 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.51 
 
 		 132 aa  46.6  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.25 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.82 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  34.38 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.67 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  27.1 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.14 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.54 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  25.16 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.81 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  32.26 
 
 		 172 aa  44.7  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.88 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  26.44 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.71 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.81 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  26.17 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  44.23 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.45 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  25.23 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.1 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  24.3 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  24.3 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  24.3 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  24.3 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  27.88 
 
 		 151 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  24.53 
 
 		 178 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  28.76 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.77 
 
 		 151 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  35.16 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  35.16 
 
 		 155 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>