50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3115 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  100 
 
 
169 aa  316  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3421  FxsA  84.89 
 
 
158 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.123151  normal  0.48989 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  72.86 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  72.86 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  72.86 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  47.47 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.31 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.1 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.05 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.34 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.16 
 
 
161 aa  54.7  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.21 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  30.36 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  30.36 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  32.14 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  32.14 
 
 
129 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.59 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.59 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.59 
 
 
202 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.59 
 
 
202 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  29.66 
 
 
129 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  31.5 
 
 
129 aa  51.2  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  39.36 
 
 
155 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 
215 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  34.25 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.74 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.04 
 
 
200 aa  48.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.66 
 
 
217 aa  48.1  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 
186 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  31.43 
 
 
151 aa  46.6  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.4 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.4 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.17 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.99 
 
 
196 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0670  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.29 
 
 
151 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.65 
 
 
191 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  29.11 
 
 
96 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15960  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  28.17 
 
 
199 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.22 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.06 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.75 
 
 
182 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.61 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  25.81 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.91 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  26.36 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.61 
 
 
195 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.23 
 
 
197 aa  40.8  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>