128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2271 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2271  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 		 172 aa  319  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.237606  normal  0.0291339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2390  FxsA cytoplasmic membrane protein  86.63 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.260123  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 205 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  45.05 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  40 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.39 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.76 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.32 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.8 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  37.27 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.59 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  35.25 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  36.17 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  39.62 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.81 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3198  FxsA  27.19 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.355615  normal  0.0148258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.04 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  27.06 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0447  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.27 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.62 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.05 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  27.85 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  25.81 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.62 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.39 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  40.34 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.64 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  28.26 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1238  putative FxsA cytoplasmic membrane protein  35.95 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2899  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.95 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  29.69 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.8 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.04 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  31.37 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.22 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  34.86 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1282  FxsA cytoplasmic membrane protein  41.75 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.08 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  31.37 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.33 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.93 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.17 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.31 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1295  fxsA cytoplasmic membrane protein  29.32 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.58003  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  31.19 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  31.19 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  31.19 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0290  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.36 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.185009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.48 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  34.83 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.2 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  37.93 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  31.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  31.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  31.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  31.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  31.13 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0955  fxsA protein  27.7 
 
 		 172 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.951475  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.98 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  36 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  29.31 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.58 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 187 aa  52.4  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.68 
 
 		 165 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  33.96 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.19 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.71 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4267  FxsA  39.66 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.04 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.98 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  22.88 
 
 		 129 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  30 
 
 		 196 aa  50.8  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  27.27 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.33 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  28.28 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  27.83 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  22.03 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  22.03 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  22.03 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  22.03 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.26 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  23.14 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  22.03 
 
 		 129 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  21.8 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  21.19 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  21.85 
 
 		 129 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  21.19 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0327  FxsA  27.96 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333824 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  39.29 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04010  inner membrane protein  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3852  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  34.51 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03972  hypothetical protein  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4381  FxsA  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.235935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4695  FxsA  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3872  FxsA  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4669  FxsA  30.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>