12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2197 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2197  FxsA cytoplasmic membrane protein  100 
 
 
184 aa  343  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2483  FxsA cytoplasmic membrane protein  39.62 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.415568  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3115  FxsA  34.05 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173098  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12090  FxsA  40.78 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0508587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2537  FxsA  33.09 
 
 
155 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.291764  normal  0.606728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2500  FxsA  33.09 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.744605  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2545  FxsA  33.09 
 
 
155 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  25.76 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.35 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.31 
 
 
192 aa  42  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.65 
 
 
173 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3715  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.46 
 
 
192 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.238341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>