116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1761 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1761  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  100 
 
 
224 aa  428  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0813114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1534  FxsA cytoplasmic membrane protein  48.31 
 
 
186 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.161841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1806  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.65 
 
 
170 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5815  FxsA-like protein  38.18 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0514097  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2668  FxsA cytoplasmic membrane protein  42.73 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.414082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0083  FxsA cytoplasmic membrane protein  40.82 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3664  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.71 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0363971  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0418  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.36 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000190293  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03920  fxsA protein  37.07 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0585  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.11 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4958  FxsA  36.15 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.276785  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57030  FxsA  34.23 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0540  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.5 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0336938  decreased coverage  0.00333151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4156  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.4 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306524  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2684  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.06 
 
 
129 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4013  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.4 
 
 
191 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3285  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.15 
 
 
131 aa  62.8  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0437  FxsA cytoplasmic membrane protein  32.14 
 
 
158 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0113799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0964  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.97 
 
 
131 aa  62.4  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865324 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2035  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.43 
 
 
159 aa  62.4  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.923078  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14100  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  36.61 
 
 
211 aa  62.4  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0286882  normal  0.429817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4491  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4326  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4338  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0110569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4842  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3944  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.96 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2208  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0638  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.68 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0665  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.68 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4723  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0661  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.68 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4728  FxsA  29.57 
 
 
129 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2268  FxsA  39.62 
 
 
161 aa  60.1  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3319  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.72 
 
 
130 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4427  FxsA  30.43 
 
 
129 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2805  FxsA  35.19 
 
 
167 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06350  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.82 
 
 
151 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000272141  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3016  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.07 
 
 
131 aa  59.7  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0530  FxsA  27.97 
 
 
129 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3724  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.03 
 
 
202 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.51 
 
 
239 aa  58.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3281  FxsA  32.97 
 
 
151 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1249  FxsA cytoplasmic membrane protein  32 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4707  FxsA  27.97 
 
 
129 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1365  FxsA  35.05 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3405  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.08 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2923  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.63 
 
 
154 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000984187  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2785  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.05 
 
 
192 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37721  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00153  FxsA  35.24 
 
 
178 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002215  protein affecting phage T7 exclusion by the F plasmid  35.24 
 
 
172 aa  56.6  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0192  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.13 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0407  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.25 
 
 
178 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000598629 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4712  putative fxsA cytoplasmic membrane protein  31.71 
 
 
96 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0772  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.7 
 
 
130 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2422  FxsA protein  34.41 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00614218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0492  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.96 
 
 
202 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2705  FxsA cytoplasmic membrane protein  33.54 
 
 
173 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.03406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1359  FxsA  34.15 
 
 
153 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00729111  normal  0.184311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3215  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.44 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1830  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.51 
 
 
161 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0507  FxsA cytoplasmic membrane protein  37.5 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.198266  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0698  fxsA protein  34.71 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4379  cytoplasmic membrane family protein  38.28 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4074  FxsA  37.59 
 
 
164 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.283215  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3484  FxsA  29.45 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.696908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4365  FxsA  34.15 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403503  normal  0.04543 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0726  FxsA cytoplasmic membrane protein  38.46 
 
 
156 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4490  FxsA  34.15 
 
 
153 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00316913  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3531  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.04 
 
 
166 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0882  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.71 
 
 
158 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000346375  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0841  FxsA cytoplasmic membrane protein  35.64 
 
 
161 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0842342  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0847  FxsA  27.65 
 
 
169 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.635008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3677  FxsA  30.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0724  FxsA  30.69 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3824  FxsA  30.69 
 
 
195 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3941  FxsA  29.59 
 
 
168 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.762293  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2032  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.96 
 
 
175 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.178119  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0261  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.75 
 
 
132 aa  52.4  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3245  FxsA cytoplasmic membrane protein  29.7 
 
 
197 aa  52  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0792  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.86 
 
 
200 aa  52  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3404  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.50678  hitchhiker  0.00954058 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0548  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0925421  normal  0.234648 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3574  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.965876  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1580  FxsA  40.37 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.413909  normal  0.915122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2158  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.26 
 
 
170 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.900116  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3264  FxsA cytoplasmic membrane protein  30.58 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.113686  hitchhiker  0.00449743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3446  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.93 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0552  FxsA cytoplasmic membrane protein  24.8 
 
 
163 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000293084  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_004310  BR2073  FxsA  26.47 
 
 
165 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1790  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.43 
 
 
130 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.611634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1993  FxsA  26.47 
 
 
165 aa  49.7  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4688  FxsA  32.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4745  FxsA  32.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.689365 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4597  FxsA  32.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4605  FxsA  32.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4724  FxsA  32.58 
 
 
158 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2856  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.29 
 
 
165 aa  48.9  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.596074  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4503  FxsA  36.73 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329001  decreased coverage  0.000252852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3609  FxsA cytoplasmic membrane protein  31.86 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.540395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3462  FxsA cytoplasmic membrane protein  34.86 
 
 
155 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.21312  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2675  FxsA cytoplasmic membrane protein  36.49 
 
 
159 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.546891  normal  0.675793 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>